En la década de los años veinte, ya se practicaba el fútbol por muchos aficionados en esta localidad toledana.
Se sabe que este equipo permaneció activo durante los años treinta y, parece ser que durante la guerra civil española se jugaron algunos partidos entre los jóvenes no incorporados a filas.
Ya en 1946, cuando los efectos de la guerra se iban suavizando y el tiempo para el deporte era más llevadero, dos personas que a la postre llegaron a ser presidente (Antonio Pastor) y entrenador (Rafael Martín) decidieron fundar un club con entidad.
Illescas quedó encuadrado en el grupo IV junto a los equipos de Camarena, Fuensalida, Pantoja y Yuncler.
Paralelamente a este incremento, el club fue escalando las diversas categorías hasta alcanzar la 1.ª Regional.
El club disputó una fase de ascenso a 2.ª B en la temporada 2009/2010, acabando como subcampeón del grupo XVIII.
En los años posteriores y tras la restructuración de las ligas nacionales, el equipo crearía un gran proyecto para intentar ascender a la nueva Segunda Federación.