Aunque la maqueta pasa inadvertida, en el año 1987 sacan otra llamada Battalions of Fear, con Christoph Theissen en la segunda guitarra y Hans-Peter Frey en la batería.
También hay un tema dedicado a la novela Dune, de Frank Herbert, Traveller In Time.
Su quinto álbum se lanza en 1995 bajo el título de Imaginations From The Other Side y viene precedido por el sencillo A Past And Future Secret.
Durante 1997, Thomas Stauch colabora con Iron Savior, banda formada por Piet Sielck y completada con Kai Hansen.
Por su parte Hansi junto con Jon Schaffer, guitarrista de Iced Earth, dan inicio al proyecto que luego sería Demons & Wizards.
En Nightfall in Middle-Earth Hansi deja el bajo y Oliver Holzwarth, hermano del baterista de Rhapsody of Fire, lo reemplaza hasta la fecha.
El grupo finalmente decidió concentrarse en su próximo álbum, como el propio Marcus Siepen afirmó: «En ese momento estábamos trabajando en las canciones de A Night at the Opera y, si hubiéramos tenido que hacer la banda sonora, no habría existido disco de Blind Guardian en 2002».
Después de un largo descanso, en 2002 sale el álbum que llevaría como nombre A Night at the Opera.
En 2004 salió un DVD con el festival y algunas escenas de la gira anterior, llamado Imaginations Through The Looking Glass.
En 2005 el batería de la banda, Thomen Stauch abandona la formación por diversas discrepancias respecto a como deberían continuar su trabajo, formando el grupo Savage Circus.
A finales de año es sustituido por Frederik Ehmke, un batería nacido en Malsch (Alemania), prácticamente desconocido hasta entonces.
También recientemente ha participado en la banda sonora de la película En el nombre del rey, con su balada «Skalds and Shadows».
Las canciones «Ride into Obsession» y «Wheel of Time» están basadas en la obra de Robert Jordan La rueda del tiempo.
En 2011 dieron una gira por Iberoamérica promocionando su última producción, en países como Argentina, Brasil, Chile, Colombia, Venezuela, Costa Rica, El Salvador, Guatemala[4] y México.