Álvarez debutó en la Major League Soccer con el San Jose Earthquakes en 2003, siendo este su primer club profesional, firmando un contrato por tres años.

Álvarez con el equipo californiano acumuló 373 minutos, haciedo un total de 11 apariciones y anotando 2 goles en su estadía en el club.

Sin embargo, Álvarez terminó su contrato con FC Dallas, y posteriormente fue elegido por el San Jose Earthquakes En julio de 2008 Álvarez regreso a california precisamente a los terremotos de San Jose.

Se despidiria del club californiano con 11 goles en 54 partidos siendo ídolo azul.

Sin embargo, el recibió el interés de clubes europeos, según su agente, y se esperaba que mover sus servicios allí más tarde en su carrera.

Al minuto 77, el técnico Ulisses Morais hizo ingresar a Álvarez en sustitución de Sai Sassa; por lo que el cuscatleco logró debutar al jugar los últimos 13 minutos del juego.

Una vez terminado sus dos años de contrato con el equipo Húngaro, Alvares paso un total de 6 meses sin equipo; incluso Se creía que este tendría su debut en la liga salvadoreña ante las propuestas de los equipos Alianza Fútbol Club y Sonsonate Fútbol Club, los cuales nunca llegaron a concretarse.

Debutando el 6 de marzo, contra el New York City en la derrota por 3-4 y asistiendo al gol del empate a su compañero Razvan Cocis a los 9' minutos.

El tanto fue convertido cuando Gilberto filtró un balón cruzado desde la banda izquierda.

El defensor DaMarcus Beasley se confió de un balón que pudo recoger fácilmente, y Álvarez aprovechó para ganarle la espalda.

Para cuando Beasley y el arquero Tyler Deric reaccionaron, el mediocampista de Chicago ya había realizado su letal toque para festejar su primer gol con la camiseta del Fire.

Álvarez no había marcado en la MLS desde la campaña 2010 cuando jugaba para el San Jose Earthquakes, previo a su paso por el Real Salt Lake y el fútbol europeo.