[7]​ La primera historia que escribió antes de ingresar al ejército fue dibujada por Al Williamson y Roy Krenkel y fue publicada en 1962, justo después de su baja del ejército.

[8]​ Goodwin abandonó Warren en 1967, pero contribuyó ocasionalmente historias durante los siguientes 15 años e incluso regresó a la editorial por un breve período como editor en 1974.

[11]​ Goodwin trabajó brevemente para DC Comics durante la década de 1970, donde editó las historietas bélicas GI Combat, Our Fighting Forces y Star Spangled War Stories, y reemplazó a Julius Schwartz como editor de Detective Comics durante un año.

Haber hecho eso y que DC me haya dado la oportunidad de hacerlo fue genial.

[20]​ Goodwin trabajó por primera vez para Marvel Comics en 1968 como el primer escritor de la serie Iron Man, lanzada ese mismo año.

Gracias a Dios que no estaba escribiendo Millie the Model cuando entré».

[21]​ Goodwin y el artista George Tuska cocrearon al supervillano Controlador en Iron Man #12 (abril de 1969).

[21]​En 1976, Goodwin reemplazó a Gerry Conway como editor en jefe de Marvel Comics, convirtiéndose en la octava persona en ocupar este cargo, con el entendimiento de que solo sería una asignación temporal hasta encontrar a un reemplazo permanente; renunció a finales de 1977 y fue reemplazado por Jim Shooter.

[27]​ Mientras Goodwin fue editor en jefe, Marvel aseguró los derechos para publicar la adaptación a historieta de la película Star Wars y una serie de historietas basada en ella, la cual se vendió excepcionalmente bien en un momento en que la industria del cómic estaba en grave declive, en parte debido a la escasez de otros productos Star Wars.

Goodwin recordó sobre el cómic de Star Wars: «eso realmente funcionó... pero no puedo tomar ningún crédito por ello.

Russ Helm era una persona completamente diferente que escribía bajo su propio nombre».

En 1979, Goodwin escribió una adaptación de la película Alien: el octavo pasajero llamada Alien: The Illustrated Story, con arte de Walt Simonson y publicada por la revista Heavy Metal.

[33]​ Esta revista fue editada en un principio por Rick Marschall, pero Shooter se acercó al editor Stan Lee para que fuera reemplazado: Le dije a Stan: «Hay un tipo que podría hacer esto.

La razón por la que no pensé que podríamos conseguirlo es porque él solía ser mi jefe y no sabía cómo se sentiría si regresaba y yo fuera su jefe.

[3]​Goodwin en ese momento trabajaba para Marvel como escritor y Shooter recuerda haber tramado un plan en el que la compañía «fingía que Archie estaba bajo el cargo de Stan.

Goodwin inicialmente se opuso a la carga de trabajo adicional y Shooter asignó la línea a Al Milgrom pero finalmente aceptó el cargo de editor.

[4]​ Entre los proyectos más notables de Goodwin como editor se encuentran Starman (1994), escrito por James Robinson, y Batman: The Long Halloween (1996-1997) escrito por Jeph Loeb y dibujado por Tim Sale.

El primer trabajo de Loeb y Sale sobre Batman apareció en Batman: Legends of the Dark Knight Halloween Special #1 (diciembre de 1993) editado por Goodwin,[43]​ y Loeb ha dicho que se inspiró en Goodwin al escribir el personaje James Gordon en The Long Halloween y su secuela Batman: Dark Victory.

1 #15, con globos de pensamiento que lo muestran probando varios apodos para sí mismo.