La banda no ha publicado una declaración oficial fuera de Patreon que confirme su ruptura.En 1993 tras tocar en varias bandas Pat y Justin Sane deciden retomar un proyecto propio.Comenzaron a tocar por diversos lugares; finalmente en el verano de 1995 dieron una gira por todo Estados Unidos.Estando nuevamente sin bajista, un fanático les pide que lo dejen ocupar ese puesto: Chris #2, con quien graban "A New Kind of Army", y Tom Morello le invita a un tour con Rage Against the Machine.También participan en el Warped Tour, y después graban en Iguana Studios "Underground Network" que sale a inicios del 2001.En el año 2005 la banda firma un contrato con el sello RCA, con el cual editaron su nuevo álbum "For Blood and Empire", en 2006.Tres años más tarde, en marzo de 2012 el grupo publicó el álbum "The General Strike".Algunos creen que el nombre indica un sentimiento antiamericano pero, en concordancia con las declaraciones en su disco A New Kind of Army, «Anti-Flag no significa anti-América.
