John's Seminary College, donde recibió su licenciatura en filosofía en 1954, y luego continuó sus estudios en Roma en la Pontificia Universidad Gregoriana hasta 1958.

A su regreso a los Estados Unidos, se convirtió en profesor, como así como director espiritual y conferencista, en su alma mater del Seminario de San Juan en 1962.

Hughes se desempeñó como Rector del Seminario de St.

Su mandato estuvo marcado por el devastador huracán Katrina en 2005, después de lo cual hizo una aparición televisada con el obispo Robert Muench (su sucesor en Baton Rouge), diciendo , “Dios nos ha puesto de rodillas ante el desastre.

Nuestra fe nos enseña a hacer esto último, a creer realmente que Dios está presente y nos pide que seamos sus socios en la recuperación y restauración”.

Por esto, se disculpó y dijo: “Nuestra acción o inacción no logró proteger a los inocentes entre nosotros, los niños.

[4]​ Hughes hizo hincapié en la evangelización como tema principal de su mandato.