En la temporada 2014-15, se integró al plantel absoluto, estuvo en el banco de suplentes en varias oportunidades del Torneo Apertura.

River finalizó el torneo en cuarta posición, superado por Peñarol, Racing y quien resultó campeón, Nacional.

River completó un buen Clausura, quedaron en segundo lugar tras Peñarol y clasificaron por primera vez en su historia a una fase de la Copa Libertadores.

Tuvo una participación irregular, fue titular en los 8 partidos que disputó y recibió 4 tarjetas amarillas.

En el Torneo Clausura 2016, fue capitán del equipo por primera vez el 6 de marzo, su rival fue Racing y ganaron 1 a 0.

[4]​ River Plate compartió grupo en la Copa Libertadores con Nacional, Rosario Central y Palmeiras.

Pero el tercer encuentro fue contra Central en el Gigante de Arroyito ante 45.000 espectadores, y perdieron 4-1, el jugador Marco Ruben convirtió un hat-trick.

[5]​ En el cuarto encuentro del grupo, nuevamente jugaron contra Rosario Central, Agustín fue el capitán pero perdieron 1-3 en el Estadio Centenario.

[11]​ El 22 de septiembre, disputó su sexto encuentro con la Celeste,[n 2]​ fue en el Parque Saroldi contra Perú, conocía el estadio por ser el de su club River Plate, al minuto 64 convirtió su primer gol internacional para poner el 1 a 0 parcial, pero finalmente los incaicos[n 3]​ ganaron 1-2.

[14]​ No jugó el último encuentro, perdieron con Colombia y finalizaron el torneo amistoso en tercer lugar.

Dos días después, se enfrentaron al local, Paraguay, esta vez Agustín estuvo en cancha los 90 minutos y ganaron por la mínima gracias a una anotación de Jaime Báez.

Luego jugó contra Portugal como titular, pero perdieron 3 a 0 con un triplete de André Silva.