La puntuación se determina por tres puntos por victoria, uno por empate y ninguno por derrota.

Al término de las 27 jornadas los 6 mejores equipos en la tabla general avanzan a la fase final del campeonato.

En la fase final por el título, los dos mejores equipos en la temporada regular avanzan directamente a las semifinales.

Los ganadores de las semifinales disputarán el título de la A-League 2016-17 en la Gran Final a partido único en el campo del club con mejor puntuación en la temporada regular.

Clasificados a Primera ronda de la fase final.