3 trenes operan todo el tiempo, excepto a altas horas de la noche y los domingos en tempranas horas de la mañana, entre la calle 148 en Harlem, Manhattan, y la Avenida New Lots en East New York, Brooklyn, funciona como ruta express en Manhattan y ruta local en Brooklyn.

Ahora hace paradas locales hacia el sur del Ferry.

Empezando desde el 4 de enero de 1955, los ternes 3 funcionaron como rutas express en Manhattan durante horas pico y fueron redirigidos hacia la avenida Flatbush, Brooklyn durante ese tiempo.

Durante las media noches y horas tempranas de los domingos, los trenes funcionaban como rutas Shuttles (de acá para allá) entre las calles 148 y la 135 hasta 1995, cuando el "shuttle" fue dejado en desuso (excepto los domingos por la mañana y autobuses proveían servicios hacia la terminal Lenox.

La mayoría del servicio 3 volvió a funcionar en la calle 137–City College.