El FIBA EuroChallenge 2008-09 fue la sexta edición de la FIBA EuroChallenge, el tercer nivel de competiciones europeas de baloncesto, la primera con esta denominación, tras haber sido conocida anteriormente como FIBA Europe League y FIBA EuroCup.

El campeón fue el Virtus Bologna italiano.

La final four se disputó en el Futureshow Station de Bolonia, Italia.

La Final Four tuvo lugar en el Futurshow Station de Bolonia.