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Ecuación de Scatchard

La ecuación de Scatchard es una ecuación utilizada en biología molecular para calcular la afinidad y el número de sitios de unión de un receptor por un ligando . [1] Lleva el nombre del químico estadounidense George Scatchard. [2]

Ecuación

En este artículo, [ RL ] denota la concentración de un complejo receptor-ligando, [ R ] la concentración de receptor libre y [ L ] la concentración de ligando libre (de modo que la concentración total del receptor y del ligando son [ R ]+[ RL ] y [ L ]+[ RL ], respectivamente). Sea n el número de sitios de unión para el ligando en cada molécula de receptor y sea n el número promedio de ligandos unidos a un receptor. Sea K d la constante de disociación entre el ligando y el receptor. La ecuación de Scatchard está dada por

Al representar gráficamente n /[ L ] versus n , el gráfico de Scatchard muestra que la pendiente es igual a -1/ K d mientras que la intersección con x es igual al número de sitios de unión del ligando n .

Derivación

norte=1 Ligando

Cuando cada receptor tiene un único sitio de unión del ligando, el sistema se describe mediante

con una tasa de activación ( k activada ) y una tasa de desactivación ( k desactivada ) relacionadas con la constante de disociación a través de K d = k desactivada / k activada . Cuando el sistema se equilibra,

de modo que el número promedio de ligandos unidos a cada receptor viene dado por

que es la ecuación de Scatchard para n = 1.

norte=2 Ligandos

Cuando cada receptor tiene dos sitios de unión de ligando, el sistema está gobernado por

En equilibrio, el número promedio de ligandos unidos a cada receptor viene dado por

lo que es equivalente a la ecuación de Scatchard.

Caso general denorteLigandos

Para un receptor con n sitios de unión que se unen independientemente al ligando, cada sitio de unión tendrá una ocupación promedio de [ L ]/( K d + [ L ]). Por lo tanto, al considerar los n sitios de unión, habrá

ligandos unidos a cada receptor en promedio, de donde se desprende la ecuación de Scatchard.

Problemas con el método

El método de Scatchard se utiliza menos en la actualidad debido a la disponibilidad de programas informáticos que ajustan directamente los parámetros a los datos de unión. Matemáticamente, la ecuación de Scatchard está relacionada con el método de Eadie-Hofstee , que se utiliza para inferir propiedades cinéticas a partir de datos de reacciones enzimáticas. Muchos métodos modernos para medir la unión, como la resonancia de plasmón superficial y la calorimetría de titulación isotérmica, proporcionan parámetros de unión adicionales que se ajustan globalmente mediante métodos iterativos basados ​​en computadora. [ cita requerida ]

Referencias

  1. ^ Scatchard, George (1949). "La atracción de las proteínas por moléculas pequeñas e iones". Anales de la Academia de Ciencias de Nueva York . 51 (4): 660–672. Código Bibliográfico :1949NYASA..51..660S. doi :10.1111/j.1749-6632.1949.tb27297.x. S2CID  83567741.
  2. ^ Voet, Donald (1995). Bioquímica, 3.ª edición . John Wiley & Sons, Inc. ISBN 978-0-471-39223-1.

Lectura adicional