El torneo de béisbol de la División I de la NCAA de 1999 se jugó al final de la temporada de béisbol de la División I de la NCAA de 1999 para determinar el campeón nacional de béisbol universitario . El torneo se amplió a 64 equipos para 1999, añadiendo un Súper Regional. El torneo concluyó con ocho equipos compitiendo en la College World Series , un torneo de doble eliminación en su quincuagésimo tercer año. Se llevaron a cabo dieciséis competencias regionales para determinar los participantes en el evento final, y cada ganador avanzó a una serie al mejor de tres contra otro campeón regional por el derecho a jugar en la Serie Mundial Universitaria. Cada región estaba compuesta por cuatro equipos, lo que resultó en 64 equipos que participaron en el torneo al final de su temporada regular y, en algunos casos, después de un torneo de conferencia. [1] El campeón del quincuagésimo tercer torneo fue Miami (FL) , entrenado por Jim Morris . El jugador más destacado fue Marshall McDougall de la Universidad Estatal de Florida .
Negrita indica participante de CWS.
Negrita indica ganador.
Presentado por Rice en el Astrodome
Los siguientes jugadores fueron miembros del equipo de todo el torneo de la Serie Mundial Universitaria.