En el Torneo de hockey sobre hielo masculino de la División II de la NCAA de 1999, participaron dos escuelas en una serie al mejor de tres juegos para determinar el campeón nacional de hockey sobre hielo universitario masculino de la División II de la NCAA . Se jugaron un total de dos juegos, organizados por Saint Michael's College .
Saint Michael's , entrenado por Lou DiMasi, ganó el título nacional sobre New Hampshire College , con una victoria y un empate.
Chuck Croteau y Jason Harrington, fueron los máximos anotadores del torneo con cuatro puntos cada uno.
Después del campeonato, el torneo se suspendió debido a la falta de interés de las escuelas en el nivel de División II.
Se invitó a dos equipos a jugar un torneo modificado al mejor de tres . En los dos primeros partidos, los equipos recibirían puntos (2 puntos por victoria, un punto por empate) y el equipo que obtuviera más puntos sería el campeón. Si los equipos empataran después de dos partidos, se jugaría un minijuego de 20 minutos para determinar el campeón.
Nota: * indica períodos de tiempo extra.
Nota: Minijuegos en cursiva.
No se ha concedido ninguno