El torneo de baloncesto masculino MAC de 1999 , parte de la temporada 1998-99 de baloncesto masculino de la División I de la NCAA , se llevó a cabo en el SeaGate Centre en Toledo, Ohio . Fue un torneo de eliminación simple con tres rondas e incluyó solo a los ocho mejores equipos de la conferencia. La ronda de cuartos de final se llevó a cabo en los campus de los cuatro primeros clasificados, y los ganadores avanzaron para jugar las rondas semifinales y final en Toledo. Fue el último torneo de baloncesto masculino de la Conferencia Mid-American que no incluyó a todos los miembros de la conferencia, y el torneo final se llevó a cabo en Toledo. Miami , el ganador de la temporada regular de la MAC, recibió el puesto número uno en el torneo. El segundo clasificado Kent State ganó el torneo con una victoria de 49-43 sobre Miami y recibió la oferta automática de la Conferencia Mid-American para el torneo de la NCAA de 1999. Fue la primera victoria del Torneo MAC de Kent State y marcó su primera aparición en el Torneo de la NCAA. Miami fue seleccionado como una entrada general para el Torneo de la NCAA. Durante la temporada 2016-17, fue la última vez que la MAC tuvo más de un equipo participando en el Torneo de la NCAA.
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* – Indica período de horas extras