El superreino Metakaryota fue definido por Thomas Cavalier-Smith como eucariotas avanzados resultantes de la endosimbiosis de una proteobacteria , dando origen a la mitocondria , por un eucariota arquezoario . Sin embargo, con el colapso de la hipótesis Archezoa (que los eucariotas amitocondriados eran basales), esta agrupación fue abandonada en esquemas posteriores. [2] [3]
En 2023, utilizando el análisis filogenético molecular de 186 taxones, Al Jewari y Baldauf propusieron un árbol filogenético con la metamonad Parabasalia como eucariotas basales. Discoba y el resto de los eucariotas parecen haber surgido como taxón hermano de Preaxostyla, incorporando una única alfaproteobacteria como mitocondria por endosimbiosis. Por lo tanto, los Fornicata están más estrechamente relacionados con los animales, por ejemplo, que con Parabasalia. El resto de los eucariotas surgieron dentro de los Excavata como hermanos de Discoba. [4] Caesar al Jewari y Sandra Baldauf argumentan en cambio que los eucariotas posiblemente comenzaron con un evento de endosimbiosis de una deltaproteobacteria o gammaproteobacteria, lo que explica la presencia, de otro modo inexplicable, de enzimas bacterianas anaeróbicas en metamonada en este escenario. La hermana de Preaxostyla dentro de Metamonada representa al resto de Eucariotas que adquirieron una alfaproteobacteria.