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termómetro IbpB

El termómetro IbpB es un elemento termómetro de ARN que se encuentra en el operón ibpAB . [1] El operón contiene dos genes de choque térmico, que codifican las proteínas de unión a cuerpos de inclusión A y B (IbpA/B), y es el operón con regulación positiva más drástica bajo choque térmico en Escherichia coli . [2]

IbpA está regulado por un elemento ROSE que se encuentra en su 5'UTR , [3] [4] mientras que IbpB tiene su propio elemento regulador cis sensible al calor . La actividad de este termorregulador se confirmó in vitro pero no se encontró in vivo , lo que sugiere que existe una regulación de operones más complicada en las células bacterianas. [1]

proteína IbpB

La proteína IbpB, cuya expresión está regulada por el termómetro IbpB, es idéntica en un 48% a la IbpA (a nivel de secuencia de aminoácidos ), pero desempeña un papel diferente en el choque térmico. Cuando IbpB está ausente, la proteína IbpA formará fibrillas largas , lo cual es inusual para una proteína de choque térmico ; IbpB, actuando como co-chaperona , inhibe la formación de esta estructura por parte de IbpA. [5]

Bajo choque térmico, la proteína IbpB se disocia para dar dos subunidades más pequeñas y también reordena su estructura terciaria . [6] Se cree que esta "notable transformación conformacional" [7] es esencial para que IbpB actúe como co-chaperona con IbpA bajo choque térmico. [8]

Se ha descubierto que IbpB se mantiene activo durante un tiempo significativo después de que se ha eliminado un estímulo de choque térmico. [7]

Referencias

  1. ^ ab Gaubig LC, Waldminghaus T, Narberhaus F (enero de 2011). "Múltiples capas de control gobiernan la expresión del operón de choque térmico ibpAB de Escherichia coli". Microbiología . 157 (Parte 1): 66–76. doi : 10.1099/mic.0.043802-0 . PMID  20864473.
  2. ^ Richmond CS, Glasner JD, Mau R, Jin H, Blattner FR (octubre de 1999). "Perfiles de expresión de todo el genoma en Escherichia coli K-12". Investigación de ácidos nucleicos . 27 (19): 3821–3835. doi : 10.1093/nar/27.19.3821. PMC 148645 . PMID  10481021. 
  3. ^ Waldminghaus T, Gaubig LC, Klinkert B, Narberhaus F (septiembre-octubre de 2009). "El termómetro de Escherichia coli ibpA se compone de elementos estructurales estables e inestables". Biología del ARN . 6 (4): 455–463. doi : 10.4161/rna.6.4.9014 . PMID  19535917.
  4. ^ Waldminghaus T, Fippinger A, Alfsmann J, Narberhaus F (diciembre de 2005). "Los termómetros de ARN son comunes en proteobacterias alfa y gamma". Química Biológica . 386 (12): 1279-1286. doi :10.1515/BC.2005.145. PMID  16336122.
  5. ^ Ratajczak E, Strózecka J, Matuszewska M, Zietkiewicz S, Kuczyńska-Wiśnik D, Laskowska E, Liberek K (junio de 2010). "IbpA, la pequeña proteína de choque térmico de Escherichia coli, forma fibrillas en ausencia de su cochaperona IbpB". Cartas FEBS . 584 (11): 2253–2257. doi : 10.1016/j.febslet.2010.04.060 . PMID  20433838.
  6. ^ Shearstone JR, Baneyx F (abril de 1999). "Caracterización bioquímica de la pequeña proteína de choque térmico IbpB de Escherichia coli". La Revista de Química Biológica . 274 (15): 9937–9945. doi : 10.1074/jbc.274.15.9937 . PMID  10187768.
  7. ^ ab Jiao W, Hong W, Li P, Sun S, Ma J, Qian M, Hu M, Chang Z (febrero de 2008). "La actividad chaperona dramáticamente aumentada de la pequeña proteína de choque térmico IbpB se retiene durante un período prolongado de tiempo después de que se elimina la condición de estrés". La revista bioquímica . 410 (1): 63–70. doi :10.1042/BJ20071120. PMID  17995456.
  8. ^ Jiao W, Qian M, Li P, Zhao L, Chang Z (abril de 2005). "El papel esencial de los extremos flexibles en la capacidad de respuesta a la temperatura del estado oligomérico y la actividad similar a la chaperona de la proteína de choque térmico pequeña polidispersa IbpB de Escherichia coli". Revista de biología molecular . 347 (4): 871–884. doi :10.1016/j.jmb.2005.01.029. PMID  15769476.