La temporada 2008-09 de hockey sobre hielo masculino de la División III de la NCAA comenzó el 17 de octubre de 2008 y concluyó el 21 de marzo del año siguiente. Esta fue la 36.ª temporada de hockey sobre hielo universitario de la División III .
Nota: Los minijuegos no están incluidos en la clasificación final.
Nota: * indica períodos de horas extras
[1]