La temporada 2008-09 de la Gamma Ethniki fue la 26.ª desde el establecimiento oficial de la tercera división del fútbol griego en 1983. Comenzó el 14 de septiembre de 2008 y terminó el 3 de mayo de 2009. 36 equipos compiten en la liga, divididos en dos grupos de 18 clubes cada uno, utilizando ciertos criterios geográficos. 23 de los clubes participantes han competido en la temporada 2007-08 , 3 de ellos han descendido de la Beta Ethniki , mientras que 10 de ellos han ascendido de la Delta Ethniki . Los campeones de la temporada pasada del Grupo Norte fueron Kavala y Diagoras del Grupo Sur .
Los siguientes clubes descendieron del Beta Ethniki la temporada pasada :
Los siguientes clubes consiguieron un lugar en Gamma Ethniki al evitar el descenso o al no lograr el ascenso:
Los siguientes clubes fueron promovidos a Gamma Ethniki como campeones de sus respectivos grupos Delta Ethniki :
Los clubes mencionados anteriormente se dividieron en dos grupos según su origen geográfico. La mayoría de los clubes que provienen de la parte sur del país (incluidos Ática , Peloponeso , Creta , las islas del Egeo y la mitad de Sterea Ellada ) participarán en el Grupo 1 del Sur , mientras que los clubes del centro y norte de Grecia (incluidos Macedonia , Tracia , Epiro , Tesalia , las islas Jónicas y parte de Sterea Ellada ) participarán en el Grupo 2 del Norte .
