La temporada 2006-07 de Segunda División es la decimotercera temporada de la Segunda División escocesa en su formato actual de diez equipos.
Greenock Morton ascendió a Primera División como campeón de Liga. Stirling Albion , Raith Rovers y Brechin City ingresan a los playoffs de ascenso/descenso por un lugar en Primera División junto con Airdrie United , que terminó segundo último de la Primera División.
Forfar Athletic descendió a Tercera División, mientras que Stranraer ingresa a los playoffs de ascenso/descenso con los equipos segundo, tercero y cuarto clasificados de Tercera División: Arbroath , Queen's Park y East Fife respectivamente.
Descendió de Primera División a Segunda División
Ascendió de Segunda División a Primera División
Descendió de Segunda División a Tercera División
Ascendió de Tercera a Segunda División
La asistencia media de los clubes de Segunda División durante la temporada 2006/07 se muestra a continuación:
El noveno clasificado de Segunda División se enfrentó al cuarto clasificado de Tercera División y el tercer clasificado de Segunda División se enfrentó al segundo clasificado de Segunda División. Los play-offs se jugaron a dos partidos y el equipo ganador de cada semifinal avanzó a la final.
Primeros partidos
Partidos de vuelta
Los dos ganadores de las semifinales se enfrentaron a dos partidos. El equipo ganador obtuvo una plaza en la Segunda División 2008-09 .
Primera pierna
Segunda pierna
El Queen's Park ascendió a Segunda División