El Rugby Pro D2 2006-07 es una competición de clubes de rugby francesa. La temporada coincide con la competición Top 14 2006-07 , que es la máxima competición de clubes. Al final de la temporada, Auch fue campeón y, por tanto, ascendió automáticamente al Top 14 . Finalmente les siguió Dax , que venció a La Rochelle en la final y consiguió el segundo puesto de ascenso. Los Colomiers fueron relegados a Fédérale 1 ; Limoges terminó en un lugar de descenso, pero obtuvo un indulto cuando a Gaillac se le negó una licencia profesional para la temporada 2007-08 debido a graves problemas financieros. La temporada 2006-07 también se destacó por el fichaje de mejores jugadores por parte de Toulon , como Tana Umaga , que jugó para ellos durante un período durante la temporada.