La SEB Korvpalli Meistriliiga 2005-06 fue la decimoquinta temporada de la liga de baloncesto de Estonia y la segunda bajo el patrocinio principal de SEB . Incluyendo las ediciones anteriores de la competición, esta fue la 81ª temporada de la liga de baloncesto masculino de Estonia.
La temporada comenzó el 5 de octubre de 2005 y concluyó el 30 de mayo de 2006 con Kalev/Cramo derrotando a TÜ/Rock 4 juegos a 3 en las Finales KML de 2006 para ganar su segundo título de la Liga de Estonia. [1]