La Top League 2003-04 fue la primera temporada de la competición nacional de rugby de Japón , la Top League . Toshiba Brave Lupus ganó la liga al terminar en la cima de la competencia de todos contra todos.
Toshiba Brave Lupus perdió la final de la Copa Microsoft ante NEC Green Rockets , pero la copa se consideraba una competición separada de la Top League antes de 2007.
Los ocho mejores equipos de la liga jugaron el torneo eliminatorio de la Copa Microsoft (2004), que ganó NEC Green Rockets .
IBM Big Blue y Toyota Verblitz ganaron el ascenso a la Top League 2004-05 a través de la Top League Challenge Series 2004, mientras que Kyuden Voltex y Toyota Industries Shuttles avanzaron a los play-offs de promoción.
Se jugaron dos partidos de ascenso/descenso (Irekaesen) y los ganadores se clasificaron para la Top League 2004-05 . El equipo que ocupa el décimo lugar de la Top League contra el equipo que ocupa el tercer lugar del Desafío 1. El equipo que ocupa el noveno lugar de la Top League contra el equipo que ocupa el primer lugar del Desafío 2.
Entonces Kinetsu y Ricoh permanecieron en la Top League durante la temporada 2004-05.