La temporada 2003-04 fue la 62.ª en la historia de la Eastern Counties Football League, una competición de fútbol en Inglaterra. [1]
El AFC Sudbury fue campeón, ganando su cuarto título consecutivo de la Eastern Counties Football League después de que se formara el nuevo club en 1999, mientras que Maldon Town ascendió a la Southern Football League por primera vez en su historia.
La Premier Division contó con 20 clubes que compitieron en la división la temporada pasada, junto con dos nuevos clubes, promovidos desde la División Uno:
La División Uno contó con 17 clubes que compitieron en la división la temporada pasada, junto con cuatro clubes nuevos: