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Supresión de CG

Cómo la metilación de los sitios CpG seguida de una desaminación espontánea conduce a una falta de sitios CpG en el ADN metilado. Como resultado, se crean islas CpG residuales en áreas donde la metilación es rara y los sitios CpG se adhieren.

La supresión de CG es un término para el fenómeno de que los dinucleótidos CG son muy poco comunes en la mayoría de las partes de los genomas de vertebrados .

En los tejidos somáticos adultos, los residuos de citosina pueden metilarse , y esto ocurre casi exclusivamente dentro de un contexto CpG simétrico. [1] Los residuos C metilados se desaminan espontáneamente para formar residuos T; por lo tanto, los dinucleótidos CpG mutan constantemente a dinucleótidos TpG, lo que da lugar a la subrepresentación de dinucleótidos CpG en el genoma humano (ocurren solo en el 21% de la frecuencia esperada). [2] (Por otro lado, la desaminación espontánea de residuos C no metilados da lugar a residuos U, una mutación que es rápidamente reconocida y reparada por la célula).

En humanos y ratones , los CG son los dinucleótidos menos frecuentes , y representan menos del 1 % de todos los dinucleótidos. Los GC son los segundos más infrecuentes, y representan más del 4 % de todos los dinucleótidos, por lo que los CG son más de cuatro veces menos frecuentes que todos los demás dinucleótidos.

Véase también

Referencias

  1. ^ Law J, Jacobsen SE (2010). "Establecimiento, mantenimiento y modificación de patrones de metilación del ADN en plantas y animales". Nat. Rev. Genet . 11 (3): 204–220. doi :10.1038/nrg2719. PMC  3034103 . PMID  20142834.
  2. ^ Consorcio Internacional de Secuenciación del Genoma Humano; et al. (febrero de 2001). "Secuenciación inicial y análisis del genoma humano" (PDF) . Nature . 409 (6822): 860–921. doi : 10.1038/35057062 . PMID  11237011.