La hibridación sustractiva es una tecnología que permite la amplificación basada en PCR de solo fragmentos de ADNc que difieren entre un transcriptoma de control (controlador) y experimental . El ADNc se produce a partir del ARNm . Se destacan las diferencias en la abundancia relativa de las transcripciones, al igual que las diferencias genéticas entre especies. La técnica se basa en la eliminación del ADNbc formado por hibridación entre una muestra de control y una de prueba, eliminando así los ADNc o ADNg de abundancia similar y conservando las transcripciones o secuencias genómicas expresadas de manera diferencial o de secuencia variable.
La hibridación sustractiva de supresión también se ha utilizado con éxito para identificar secuencias de ADN específicas de cepas o especies en una variedad de bacterias, incluidas especies de Vibrio ( Metagenomics ).
Véase también
Enlaces externos
- Descripción general en evrogen.com
- Munir, S.; Singh, S.; Kaur, K.; Kapur, V. (2004). "Hibridación sustractiva de supresión acoplada con análisis de microarrays para examinar la expresión diferencial de genes en células infectadas por virus". Biological Procedures Online . 6 : 94–104. doi :10.1251/bpo77. PMC 420231 . PMID 15181476.
- Diatchenko, L. (1996). "Hibridación sustractiva por supresión: un método para generar sondas y bibliotecas de ADNc específicas de tejido o reguladas diferencialmente". Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 93 (12): 6025–6030. Bibcode :1996PNAS...93.6025D. doi : 10.1073/pnas.93.12.6025 . PMC 39182 . PMID 8650213.
- Galbraith, EA; Antonopoulos, DA; White, BA (2004). "Hibridación sustractiva supresora como herramienta para identificar la diversidad genética en un metagenoma ambiental: el rumen como modelo". Microbiología ambiental . 6 (9): 928–937. doi :10.1111/j.1462-2920.2004.00575.x. PMID 15305918.
