ARNm subgenómico

Los ARNm subgenómicos son esencialmente secciones más pequeñas de la cadena plantilla transcrita original .

ADN o ARN de 3' a 5'

Durante la transcripción , la cadena molde original se lee generalmente desde el extremo 3' al 5' de principio a fin. Los ARNm subgenómicos se crean cuando la transcripción comienza en el extremo 3' de la cadena molde (o 5' de la cadena molde que se va a sintetizar recientemente) y comienza a copiarse hacia el extremo 5' de la cadena molde antes de "saltar" al final de la cadena molde y copiar los últimos nucleótidos del extremo 5' de la cadena molde (terminando la cola 3' de la cadena recién creada).

Como resultado, la cadena traducida tendrá un extremo 5' similar en diversos grados a la plantilla original (dependiendo de qué parte de la plantilla saltó la transcripción) y un extremo 3' similar a la plantilla. ^[1]

ARN viral de 5' a 3' (sentido positivo)

El ARN viral de sentido positivo (5' a 3') que puede traducirse directamente en las proteínas virales deseadas, sufre un proceso similar al descrito en 3' a 5'. Es posible que se omitan partes del ARN viral durante la traducción.

Resultado

El resultado es que se pueden crear muchas proteínas diferentes a partir de la misma cadena de ARNm, con extremos 5' similares (en distintos grados) y los mismos extremos 3'. O se pueden crear proteínas diferentes con ARN viral de sentido positivo.

La sección 5' de la hebra recién creada coincide con la de la hebra plantilla, y esta sección de la hebra plantilla se denomina "conjunto anidado". ^[2]

3' 5' GCCGCCCCGTATCGATCGTAGCGCACGTTATATATACGTTATTTCTGCGCGGAAAAAAAAA - Plantilla original Strand 5' 3' GCCGCCCCGTATCGATCGTAGCGCACGTTATATATAC---------------AAAAAAAA | GCCGCCCCGTATCGATCGTAGCGCAC--------------------------AAAAAAAA | = ARNm subgenómico. GCCGCCCCGTAT----------------------------------------AAAAAAAA |  GCCGCCCCGTAT = Conjunto anidado - indica saltos.

Ejemplos

Este complejo método de transcripción generalmente está restringido a los virus , especialmente a los de ARN monocatenario de sentido positivo o virus de Clase IV que utilizan el Sistema de Clasificación de Baltimore , por ejemplo, los virus del orden Nidovirales .

Se utiliza principalmente para compactar más información genética en una cantidad más corta de material genético. ^[3]

Literatura

1. Wu B, White KA (diciembre de 2007). "Desacoplamiento de la replicación del virus ARN de la transcripción a través de la polimerasa: perspectivas funcionales y evolutivas". The EMBO Journal . 26 (24): 5120–30. doi :10.1038/sj.emboj.7601931. PMC  2140117 . PMID  18034156.
2. Le, TM; Wong, HH; Tay, FP; Fang, S; Keng, CT; Tan, YJ; Liu, DX (agosto de 2007). "Expresión, modificación postraduccional y caracterización bioquímica de proteínas codificadas por el ARNm8 subgenómico del coronavirus del síndrome respiratorio agudo severo". FEBS J . 274 (16): 4211–22. doi : 10.1111/j.1742-4658.2007.05947.x . PMC 7164070 . PMID  17645546. 
3. Xu W, White KA (febrero de 2008). "Transcripción subgenómica del ARNm en un virus aureus: regulación negativa de la transcripción y evolución de elementos reguladores del ARN". Virology . 371 (2): 430–8. doi : 10.1016/j.virol.2007.09.035 . PMID  17988704.