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Tomviz

tomviz es una plataforma de software de código abierto para la visualización volumétrica reproducible y el procesamiento de datos. [1] La plataforma está diseñada para una amplia gama de aplicaciones científicas, pero está especialmente diseñada para la tomografía electrónica de alta resolución , con características que permiten la alineación y reconstrucción de materiales a escala nanométrica . La plataforma tomviz permite el análisis gráfico de conjuntos de datos 3D, pero también viene empaquetada con herramientas Python , NumPy y SciPy para permitir el procesamiento y análisis avanzado de datos. La versión actual es 1.10.0. [2]

En 2022, se utilizó la plataforma tomviz para permitir la visualización 3D de muestras durante un experimento de tomografía electrónica o crioelectrónica. [3] Tomviz está construido con un flujo de trabajo de análisis de datos multiproceso que ejecuta visualizaciones dinámicas que se actualizan a medida que se recopilan nuevos datos o se ejecutan algoritmos de reconstrucción. Los científicos pueden analizar de forma interactiva la estructura de la muestra en 3D al mismo tiempo que se realiza una reconstrucción tomográfica después o durante un experimento.

Visualización volumétrica de nanocubos realizada por investigadores de la Universidad de Cornell. La reconstrucción a escala nanométrica se visualizó mediante la plataforma de análisis 3D tomviz.

Referencias

  1. ^ Hovden, Robert (22 de septiembre de 2014). "Visualización de la nanotecnología en 3D con software de código abierto". OpenSource.com.
  2. ^ "Página de descarga de Tomviz". Kitware. 8 de febrero de 2021.
  3. ^ Hovden, Robert (1 de agosto de 2022). "Análisis 3D en tiempo real durante la tomografía electrónica con tomviz". Nature Communications . 13 . doi :10.1038/s41467-022-32046-0. PMC 9343612 . PMID  35915070. S2CID  251254217.