El software de síntesis orgánica asistida por computadora es un tipo de software de aplicación utilizado en química orgánica junto con la química computacional para facilitar las tareas de diseño, predicción y producción de reacciones químicas . CAOS tiene como objetivo identificar una serie de reacciones químicas que, a partir de un compuesto de partida, pueden producir una molécula deseada . Los algoritmos CAOS suelen utilizar dos bases de datos : una primera de reacciones químicas conocidas y una segunda de materiales de partida conocidos (es decir, normalmente moléculas disponibles comercialmente). Los planes sintéticos deseables cuestan menos, tienen un alto rendimiento y evitan el uso de reacciones e intermediarios peligrosos. Generalmente planteado como un problema de planificación, se han logrado avances significativos en CAOS.
Programas CAOS
- Síntesis - [1]
- Spaya - Herramienta de planificación de retrosíntesis de libre acceso proporcionada por Iktos
- IBM Rxn - [2]
- AiZynthFinder: una herramienta de planificación retrosintética de código abierto y de libre acceso desarrollada como una colaboración entre AstraZeneca y la Universidad de Berna. AiZynthFinder predice rutas sintéticas para un compuesto objetivo determinado y se puede volver a entrenar con un conjunto de datos propio del usuario, ya sea de fuentes públicas o privadas. [1] [2] [3]
- Manifold - Herramienta de búsqueda de compuestos y planificación de retrosíntesis de libre acceso para usuarios académicos, desarrollada por PostEra
- WODCA – no hay versión de prueba; software propietario [4]
- Herramienta de exploración de síntesis orgánica (OSET): software de código abierto , abandonado [5]
- CHIRON – no hay versión de prueba; software propietario [6]
- SynGen – versión demo; software propietario ; un programa único para la generación automática de síntesis orgánica; se centra en generar las rutas sintéticas más cortas y de menor costo para un compuesto orgánico objetivo determinado y, por lo tanto, es una herramienta útil para la planificación de la síntesis
- LHASA – demostración disponible pero no vinculada (?); software propietario
- SYLVIA – versión de demostración; software propietario ; evalúa rápidamente la facilidad de síntesis de compuestos orgánicos; puede priorizar miles de estructuras (por ejemplo, generadas por experimentos de diseño de novo o recuperadas de grandes bibliotecas de compuestos virtuales) según su complejidad sintética [7]
- ChemPlanner (anteriormente ARChem – Route Designer) es un sistema experto que ayuda a los químicos a diseñar rutas sintéticas viables para sus moléculas objetivo; la base de conocimiento de las reglas de reacción se deriva algorítmicamente de las bases de datos de reacciones, y los materiales de partida disponibles comercialmente se utilizan como puntos de terminación para la búsqueda retrosintética.
- ICSYNTH – demostración disponible; software propietario ; una herramienta de diseño de síntesis asistida por computadora que permite a los químicos generar vías sintéticas para una molécula objetivo y un árbol de síntesis interactivo de múltiples pasos; en su núcleo se encuentra una base de conocimiento químico algorítmico de bibliotecas de transformación que se generan automáticamente a partir de bases de datos de reacciones. [8]
- Chematica (ahora conocida como Synthia)
- ASKCOS – Conjunto de código abierto de herramientas de planificación de síntesis y química computacional. [9]
Véase también
Referencias
- ^ GitHub de AiZynthFinder
- ^ Documento de AiZynthFinder
- ^ AiZynthFinder: conjuntos de datos y su rendimiento en el ámbito farmacéutico
- ^ WODCA
- ^ OSET
- ^ "QUIRÓN". Archivado desde el original el 16 de abril de 2015. Consultado el 18 de febrero de 2013 .
- ^ SYLVIA
- ^ SINTÉTICO IC
- ^ https://askcos.mit.edu/
