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Sitio hipersensible

Sitios hipersensibles a la DNasa I dentro de la cromatina [1]

En genética, un sitio hipersensible es una región corta de cromatina y se detecta por su súper sensibilidad a la escisión por la DNasa I y otras nucleasas diversas ( DNasa II y nucleasas microcócicas ). En un sitio hipersensible, la estructura nucleosómica está menos compactada, lo que aumenta la disponibilidad del ADN para la unión por proteínas, como los factores de transcripción y la DNasa I. Estos sitios son responsables de muchas tendencias hereditarias. [2]

Ubicación

Los sitios hipersensibles se encuentran en todos los genes activos y muchos de estos genes suelen tener más de un sitio hipersensible. La mayoría de las veces, los sitios hipersensibles se encuentran solo en la cromatina de las células en las que se expresa el gen asociado y no aparecen cuando el gen está inactivo.

En el ADN que se está transcribiendo, los sitios hipersensibles 5' aparecen antes de que comience la transcripción, y las secuencias de ADN dentro de los sitios hipersensibles son necesarias para la expresión génica . Nota: los sitios hipersensibles preceden a los promotores activos .

Los sitios hipersensibles se generan como resultado de la unión de factores de transcripción que desplazan a los octámeros de histonas .

También se pueden localizar mediante marcaje indirecto de los extremos. Se corta un fragmento de ADN una vez en el sitio hipersensible con DNasa y en otro sitio con una enzima de restricción . A continuación se mide la distancia desde el sitio de restricción conocido hasta el corte de la DNasa para obtener la ubicación.

Referencias

  1. ^ Wang, YM; Zhou, P; Wang, LY; Li, ZH; Zhang, YN; Zhang, YX (2012). "Correlación entre la distribución del sitio hipersensible a la DNasa I y la expresión génica en células HeLa S3". PLOS ONE . ​​7 (8): e42414. Bibcode :2012PLoSO...742414W. doi : 10.1371/journal.pone.0042414 . PMC  3416863 . PMID  22900019.
  2. ^ Pennisi, Elizabeth (7 de septiembre de 2012). "El proyecto ENCODE escribe un elogio al ADN basura". Science . 337 (6099): 1159–1161. Bibcode :2012Sci...337.1159P. doi :10.1126/science.337.6099.1159. PMID  22955811.