El cargo de vicepresidente de la República de Burundi se creó en junio de 1998, cuando entró en vigor una constitución de transición, y sustituyó al de primer ministro .
Pierre Buyoya , expresidente ( 1987-1993 ) que tomó el poder en un golpe militar en 1996 , juró como presidente de la República el 11 de junio de 1998. Nombró a Frédéric Bamvuginyumvira , miembro hutu del Frente para la Democracia en Burundi (FRODEBU), como primer vicepresidente. Mathias Sinamenye , miembro tutsi del partido Unión para el Progreso Nacional (UPRONA) de Buyoya , fue nombrado segundo vicepresidente.
Según la constitución de transición, la vicepresidencia constaba de dos puestos: el primer vicepresidente (responsable de los asuntos políticos y administrativos) y el segundo vicepresidente (responsable de los asuntos económicos y sociales).
El 1 de noviembre de 2001 se constituyó un nuevo gobierno de transición en el que el presidente interino Pierre Buyoya asumió el cargo durante un período de 18 meses. Al final de su mandato en 2003, el vicepresidente hutu Domitien Ndayizeye asumió el cargo y nombró vicepresidente a un tutsi ( Alphonse-Marie Kadege ). En noviembre de 2004, Kadege fue destituido como vicepresidente y reemplazado por Frédéric Ngenzebuhoro . Aunque el mandato de Ndayizeye debía finalizar a finales de 2004 tras las elecciones, el período de transición se prolongó y las elecciones previstas se retrasaron. Las elecciones se celebraron a mediados de 2005 y el período de transición debe finalizar el 26 de agosto de 2005, cuando el nuevo presidente electo asuma el cargo.
La nueva Constitución de Burundi, aprobada en referéndum constitucional el 28 de febrero de 2005 , prevé una vicepresidencia compuesta por dos miembros (similar a la del período interino). El primer vicepresidente se encargará de los asuntos políticos y administrativos, mientras que el segundo vicepresidente se ocupará de los asuntos sociales y económicos. Uno de los vicepresidentes será de etnia hutu y el otro de etnia tutsi. Los candidatos deben ser aprobados por ambas cámaras del Parlamento para poder asumir el cargo.
El 29 de agosto de 2005, el Presidente Pierre Nkurunziza nombró a Martin Nduwimana y a Alice Nzomukunda para los cargos de primer y segundo vicepresidente. Ambos recibieron la aprobación del Parlamento y prestaron juramento de inmediato. Nzomukunda dimitió el 5 de septiembre de 2006 [1] . Fue sustituida por Marina Barampama dos días después.
En febrero de 2007, Barampama fue reemplazado por Gabriel Ntisezerana . En noviembre de 2007, Nduwimana fue reemplazado por Yves Sahinguvu .
En agosto de 2010, Sahinguvu fue reemplazado por Therence Sinunguruza y Ntisezerana fue reemplazado por Gervais Rufyikiri .
El 17 de mayo de 2018 se aprobaron nuevas enmiendas constitucionales en un referéndum constitucional . Se abolirá el cargo de segundo vicepresidente. El vicepresidente restante, que tendrá poderes limitados, será elegido de un partido político y un grupo étnico diferentes a los del presidente. [2]