Secuencia descendente de PYLIS

Structure on some mRNA sequences

En biología, la secuencia descendente de PYLIS (PYLIS: secuencia de inserción de pirrolisina ) es una estructura de tallo-bucle que aparece en algunas secuencias de ARNm . Anteriormente se pensaba que este motivo estructural causaba que el codón de parada UAG (ámbar) se tradujera al aminoácido pirrolisina en lugar de finalizar la traducción de la proteína. ^{[1] [2] [3]} Sin embargo, se ha demostrado que PYLIS no tiene ningún efecto sobre la eficiencia de la supresión de UAG, ^[4] por lo tanto, incluso su nombre es, de hecho, incorrecto.

Ver también

• elemento SECIS

Referencias

1. Namy O, Rousset JP, Napthine S, Brierley I (2004). "Decodificación genética reprogramada en la expresión de genes celulares". Célula molecular . 13 (2): 157–168. doi : 10.1016/S1097-2765(04)00031-0 . PMID  14759362.
2. Théobald-Dietrich A, Giegé R, Rudinger-Thirion J (2005). "Evidencia de la existencia en los ARNm de un elemento en horquilla responsable de la inserción de pirrolisina dependiente de ribosomas en las proteínas". Bioquimia . 87 (9–10): 813–817. doi :10.1016/j.biochi.2005.03.006. PMID  16164991.
3. Zhang Y, Baranov PV, Atkins JF, Gladyshev VN (mayo de 2005). "La pirrolisina y la selenocisteína utilizan estrategias de decodificación diferentes". J. Biol. química . 280 (21): 20740–20751. doi : 10.1074/jbc.M501458200 . PMID  15788401.
4. Nombre, Olivier; Zhou, Yu; Gundllapalli, Sarath; Policarpo, Carla R.; Denise, Alain; Rousset, Jean-Pierre; Söll, Dieter; Ambrogelly, Alexandre (noviembre de 2007). "Agregar pirrolisina al código genético de Escherichia coli". Cartas FEBS . 581 (27): 5282–5288. doi : 10.1016/j.febslet.2007.10.022 . PMID  17967457.

Otras lecturas

• Longstaff DG, Blight SK, Zhang L, Green-Church KB, Krzycki JA (enero de 2007). " Requisitos contextuales in vivo para la traducción de UAG como pirrolisina". Mol. Microbiol . 63 (1): 229–241. doi :10.1111/j.1365-2958.2006.05500.x. PMID  17140411. S2CID  25346794.
• Theil tiene, C; Zambach, S; Christiansen, H (4 de abril de 2013). "Efectos del uso del potencial de codificación, la conservación de secuencias y la conservación de la estructura del ARNm para predecir genes que contienen pirrolisina". Bioinformática BMC . 14 (1): 118. doi : 10.1186/1471-2105-14-118 . PMC  3639795 . PMID  23557142.

enlaces externos

• Página para la secuencia de inserción 1 de pirrolisina en Rfam