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Secretoglobin

Las secretoglobinas (SCGB) son una familia de proteínas diméricas , pequeñas, con enlaces disulfuro y con hélices alfa que se encuentran únicamente en mamíferos. Esta familia se conocía anteriormente como la familia de células Uteroglobin/Clara de 10 kDa , por los dos alias de su miembro fundador, Uteroglobin.

Estructura y función

Las proteínas son en su mayoría alfa-helicoidales y el dímero se forma de forma antiparalela. La interfaz del dímero presenta una cavidad formada a través de los dos monómeros, que puede acomodar ligandos de tamaño pequeño a mediano, como esteroides y fosfolípidos. [1] La unión y liberación pueden estar acopladas con el estado redox de las cistinas, es decir, la presencia de estos enlaces disulfuro. [2]

Muchos tienen funciones reguladoras.

Clasificación

La familia se clasificó por homología de secuencia en 6 subfamilias en 2006. [3] Los genomas humanos y de ratón solo contienen las primeras tres familias, según una actualización de 2011. No todas las familias son monofiléticas. [4]

La prostataína de rata (proteína de unión a esteroides prostáticos de rata) es un complejo proteico tetramérico de tres componentes formado por tres genes similares a la lipofilina de los grupos 2 y 3. Algunas fuentes la describen como el ortólogo de la lipofilina. [3]

Subfamilias adicionales

Las subfamilias 4 y 6 se describieron originalmente como presentes en humanos y ratones, pero ahora se las considera duplicados de grupos existentes. La subfamilia 5 no se encuentra en ninguno de ellos. [3]

La subfamilia 4 anteriormente incluía lo que ahora se conoce como grupo 1B y 2B como grupo 4A. Los pares de genes 1B/2B (ABP) están dispuestos uno al lado del otro en el cromosoma en "módulos" que se han duplicado de forma independiente. [4]

Se suponía que la subfamilia 6 incluiría RYD5 humano y de rata, [3] ahora reasignado a Scgb1c1. [4]

Se suponía que Fel d 1 se colocaría en dos subfamilias: la cadena 1 en la subfamilia 4 y la cadena 2 en la subfamilia 5. [3] Aunque no se menciona en la actualización de 2011, las coincidencias de InterPro sugieren que CH1 es similar a 1B y CH2 es similar a 2B. [5] La investigación computacional adicional confirma la similitud, invalidando completamente las subfamilias 4 y 5. [6]

Referencias

  1. ^ Umland TC, Swaminathan S, Singh G, Warty V, Furey W, Pletcher J, Sax M (agosto de 1994). "Estructura de un complejo proteína-ligando de unión a fosfolípidos de células Clara humanas a una resolución de 1,9 A". Nature Structural Biology . 1 (8): 538–45. doi :10.1038/nsb0894-538. PMID  7664082. S2CID  28261246.
  2. ^ Härd T, Barnes HJ, Larsson C, Gustafsson JA, Lund J (noviembre de 1995). "Estructura de la solución de una proteína de unión a PCB de mamíferos en complejo con un PCB". Nature Structural Biology . 2 (11): 983–9. doi :10.1038/nsb1195-983. PMID  7583672. S2CID  10369347.
  3. ^ abcde Klug J, Beier HM, Bernard A, Chilton BS, Fleming TP, Lehrer RI, et al. (25 de enero de 2006). "Familia de proteínas de 10 kDa de células uteroglobina / Clara: informe del comité de nomenclatura". Anales de la Academia de Ciencias de Nueva York . 923 (1): 348–54. doi :10.1111/j.1749-6632.2000.tb05549.x. PMID  11193777. S2CID  38862724.
  4. ^ abcd Jackson BC, Thompson DC, Wright MW, McAndrews M, Bernard A, Nebert DW, Vasiliou V (octubre de 2011). "Actualización de la superfamilia de genes de la secretoglobina humana (SCGB) y un ejemplo de 'florecimiento evolutivo' de los genes de la proteína de unión a andrógenos dentro de la superfamilia de genes Scgb del ratón". Genómica humana . 5 (6): 691–702. doi : 10.1186/1479-7364-5-6-691 . PMC 3251818 . PMID  22155607. 
  5. ^ "Fel d 1 cadena 1", Mus musculus, "Fel d 1 cadena 2", Mus musculus. InterPro .
  6. ^ Durairaj R, Pageat P, Bienboire-Frosini C (2018). "Otro juego del gato y el ratón: descifrando la evolución de la superfamilia SCGB y explorando la similitud molecular del principal alérgeno del gato Fel d 1 y el ABP del ratón utilizando enfoques computacionales". PLOS ONE . ​​13 (5): e0197618. Bibcode :2018PLoSO..1397618D. doi : 10.1371/journal.pone.0197618 . PMC 5957422 . PMID  29771985.