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riboswitch PreQ1-II

Los ribointerruptores PreQ1-II forman una clase de ribointerruptores que se unen específicamente a la pre-queuosina 1 (PreQ 1 ), un precursor del nucleósido modificado queuosina . [1] Se encuentran en ciertas especies de Streptococcus y Lactococcus , y originalmente se identificaron como una estructura secundaria de ARN conservada llamada "motivo COG4708". [2] Todos los miembros conocidos de esta clase de riboswitch parecen controlar miembros de los genes COG4708. Se predice que estos genes codifican proteínas unidas a la membrana y se ha propuesto que sean un transportador de preQ 1 , o un metabolito relacionado, basándose en su asociación con los riboswitches de unión a preQ 1 . [1] Los riboswitches PreQ1-II no tienen similitudes aparentes en secuencia o estructura con los riboswitches preQ1-I , una clase previamente descubierta de riboswitches de unión a preQ 1 . PreQ 1 se une así a la S-adenosilmetionina como el segundo metabolito encontrado que es el ligando de más de una clase de riboswitch.

Estructura secundaria de consenso de riboswitches PreQ 1 -II. El diseño es similar al utilizado en representaciones publicadas anteriormente. [2] [1]

Referencias

  1. ^ abc Meyer MM, Roth A, Chervin SM, García GA, Breaker RR (2008). "Confirmación de una segunda clase de aptámeros preQ1 naturales en bacterias Streptococcaceae". ARN . 14 (4): 685–695. doi :10.1261/rna.937308. PMC  2271366 . PMID  18305186.
  2. ^ ab Weinberg Z, Barrick JE, Yao Z, et al. (2007). "Identificación de 22 ARN estructurados candidatos en bacterias utilizando el proceso de genómica comparativa CMfinder". Ácidos nucleicos Res . 35 (14): 4809–4819. doi : 10.1093/nar/gkm487. PMC 1950547 . PMID  17621584. 

enlaces externos