Conjunto de datos 1D: un intervalo de tiempo o frecuencia en una forma de onda
Conjunto de datos 2D: los límites de un objeto en una imagen
Conjunto de datos 3D: los contornos o superficies que delimitan un objeto (a veces conocido como Volumen de interés ( VOI )) en un volumen
Conjunto de datos 4D: el contorno de un objeto en o durante un intervalo de tiempo particular en un volumen de tiempo
Un ROI es una forma de anotación , a menudo asociada con información categórica o cuantitativa (por ejemplo, mediciones como volumen o intensidad media), expresada como texto o en forma estructurada.
Hay tres medios fundamentalmente diferentes para codificar un ROI:
Como parte integral del conjunto de datos de muestra, con un valor único o de enmascaramiento que puede o no estar fuera del rango normal de valores que ocurren normalmente y que etiqueta celdas de datos individuales
Como información separada, puramente gráfica, como con elementos de dibujo vectoriales o de mapa de bits (rasterizados), quizás con algún texto simple (no estructurado) adjunto en el formato de los datos mismos.
La imagen de la izquierda muestra una mamografía original antes del procesamiento MED-SEG. La imagen de la derecha, con la región de interés (blanca) etiquetada, muestra una mamografía después del procesamiento MED-SEG.
Los estándares de imágenes médicas como DICOM proporcionan mecanismos generales y específicos de la aplicación para respaldar diversos casos de uso.
Para imágenes DICOM (dos o más dimensiones):
Es posible que se produzcan imágenes y textos quemados dentro del rango de valores de píxeles normales (por ejemplo, como el valor blanco máximo) (obsoleto)
Los gráficos y textos superpuestos de mapas de bits (rasterizados) pueden estar presentes en bits altos no utilizados de los datos de píxeles o en un atributo separado (obsoleto)
Los gráficos vectoriales se pueden codificar en atributos de imagen separados como curvas (obsoleto)
Los gráficos vectoriales no estructurados y el texto, así como los gráficos superpuestos de mapa de bits (rasterizados), se pueden codificar en un objeto separado como un estado de presentación que hace referencia al objeto de imagen al que se aplicará.
Los datos estructurados pueden codificarse en un objeto separado como un informe estructurado en forma de un árbol de pares de nombre-valor de conceptos codificados o de texto posiblemente asociados con información cuantitativa derivada que puede hacer referencia a coordenadas espaciales y/o temporales que a su vez hacen referencia a los objetos de imagen a los que se aplican.
Las ubicaciones de referencia pueden codificarse como fiduciales en forma de coordenadas espaciales con un propósito codificado asociado, ya sea como coordenadas de píxeles por referencia a imágenes específicas o como coordenadas en un espacio cartesiano 3D relativo al paciente.
Los píxeles (posiblemente no contiguos) pueden clasificarse en segmentos codificados en un objeto de segmentación como valores binarios o probabilísticos en un ráster (que no necesita tener el mismo muestreo espacial o extensión que las imágenes de las que se derivó la segmentación); estos suelen ser referenciados por otros objetos que contienen contenido estructurado (informes estructurados).
Para radioterapia DICOM:
Los contornos de los objetos pueden definirse como conjuntos de estructuras, ya sea como coordenadas de píxeles por referencia a imágenes específicas o como coordenadas en un espacio cartesiano 3D relativo al paciente (también se utilizan para aplicaciones que no son de RT).
Para formas de onda basadas en tiempo DICOM:
Pueden aparecer valores grabados con la forma de onda (obsoleto)
Las anotaciones se pueden codificar en un atributo separado que puede seleccionar múltiples puntos de tiempo o un rango de puntos de tiempo, ya sea por número de muestra o tiempo especificado.
Los datos estructurados pueden codificarse en un objeto separado como un informe estructurado en forma de un árbol de pares de nombre-valor de conceptos codificados o de texto posiblemente asociados con información cuantitativa derivada que puede hacer referencia a coordenadas temporales que a su vez hacen referencia a los objetos de forma de onda a los que se aplican.
HL7 Clinical Document Architecture también tiene un subconjunto de mecanismos similares a (y destinados a ser compatibles con) DICOM para hacer referencia a coordenadas espaciales relacionadas con imágenes como observaciones; permite que un círculo, una elipse, una polilínea o un punto se definan como coordenadas relativas a píxeles enteros que hacen referencia a un objeto de imagen multimedia externo, que puede ser de un formato de consumidor en lugar de un formato de imagen médica (por ejemplo, GIF , PNG o JPEG ).
Sistemas de análisis de documentos
En el reconocimiento óptico de caracteres (OCR) y el análisis de diseño de documentos , las regiones de interés (ROI) abarcan jerárquicamente páginas, bloques de texto o gráficos, hasta imágenes de líneas individuales, cuadros de imágenes de palabras y caracteres. El estándar de facto en archivos y bibliotecas es el tuplete {archivo_imagen, archivo_xml}, generalmente en forma de un archivo *.tif y su archivo *.xml adjunto.
Otras aplicaciones 2D
En lo que respecta a los estándares no médicos, además de los lenguajes de marcado puramente gráficos (como PostScript o PDF ) y los formatos de archivos de dibujo de gráficos vectoriales (como SVG ) y 3D (como VRML ) que están ampliamente disponibles y que no tienen una semántica ROI específica, algunos estándares como JPEG 2000 proporcionan específicamente mecanismos para etiquetar y/o comprimir con un grado diferente de fidelidad lo que denominan regiones de interés.
Referencias
^ Ron Brinkmann (1999). El arte y la ciencia de la composición digital . Morgan Kaufmann. pp. 184. ISBN 978-0-12-133960-9.
