grid.org fue un sitio web y una comunidad en línea creado en 2001 para usuarios de software de computación en clúster y computación en red . Durante seis años, operó varios proyectos informáticos voluntarios que permitían a los miembros donar sus ciclos informáticos sobrantes a causas valiosas. En 2007, se convirtió en una comunidad para software de computación en clúster y en red de código abierto . Después de aproximadamente 2010, se redireccionó a otros sitios.
Desde su creación en abril de 2001 hasta el 27 de abril de 2007, [1] grid.org fue el sitio web y la organización que dirigió proyectos de computación distribuida como el Proyecto de Investigación del Cáncer de United Devices , dirigido por Jikku Venkat, Ph.D. y patrocinado filantrópicamente por United Devices (UD) y cuyos miembros participaron en computación voluntaria ejecutando el software UD Agent (versión 3.0).
El Proyecto de Investigación del Cáncer de United Devices, que comenzó en 2001, buscaba posibles fármacos para el tratamiento del cáncer utilizando computación distribuida . [2] Había alrededor de 150.000 usuarios en los Estados Unidos y 170.000 en Europa junto con cientos de miles más en otras partes del mundo.
El proyecto fue una alianza de varias empresas y organizaciones: [3]
United Devices lanzó el salvapantallas de investigación del cáncer bajo el principio de utilizar la potencia de computación sobrante. El programa, que podía configurarse para que se ejecutara continuamente, utilizaba un "cribado virtual" para encontrar posibles interacciones entre moléculas y proteínas objetivo, es decir, un fármaco. Estas moléculas ( ligandos ) se envían al agente UD del ordenador anfitrión. Cuando estas moléculas se acoplan con éxito a una proteína objetivo, se puntúa esta interacción para realizar más investigaciones.
La investigación constó de dos fases:
El Proyecto de Plegado del Proteoma Humano ("HPF") patrocinado por IBM , fase 1, se anunció el 16 de noviembre de 2004 y se completó el 3 de julio de 2006. El proyecto operó simultáneamente tanto en grid.org como en la World Community Grid de IBM . [7]
Se utilizó el software "Rosetta" para predecir la estructura de las proteínas humanas con el fin de ayudar a predecir la función de las proteínas. Esta información podría algún día utilizarse para ayudar a curar una variedad de enfermedades y defectos genéticos.
Según un anuncio en los foros de grid.org, [8] después de que se completó el proyecto HPF1, se dejó que continuara ejecutándose en grid.org hasta el 9 de agosto de 2006. [9] Durante ese tiempo, los miembros cuyas computadoras estaban configuradas para ejecutar este proyecto consiguieron nuevo trabajo y gastaron recursos computacionales para calcular un resultado, pero el resultado se devolvió a grid.org solo para obtener puntos; no se usó para investigación científica.
El estado del Proyecto de Plegado del Proteoma Humano provocó cierto debate en los foros de grid.org. La mayoría de los miembros querían que toda la potencia informática disponible se destinara al proyecto del cáncer, que todavía está activo, [9] pero el representante de la UD, Robby Brewer, afirmó que "a algunos [usuarios] les gusta el salvapantallas". [8] [10] Como se señaló anteriormente, al final se detuvo el trabajo redundante de HPF1 en grid.org. [9]
El proyecto Smallpox Research Grid fue parte de la iniciativa Patriot Grid de United Devices para combatir el terrorismo biológico. Este proyecto ayudó a analizar posibles fármacos candidatos para una terapia médica en la lucha contra el virus de la viruela. Se utilizó el software "LigandFit" (que ya se había utilizado en la fase 2 del proyecto Cancer Research), pero con un conjunto especializado de moléculas diana que atacaban al virus de la viruela . [11]
Los socios del proyecto incluyeron la Universidad de Oxford , la Universidad de Western Ontario , el Centro Oncológico Memorial Sloan-Kettering , la Universidad de Essex , Evotec OAI, Accelrys e IBM . [12]
La Red Comunitaria Mundial surgió en gran medida gracias al éxito de este proyecto. [ cita requerida ]
El proyecto de investigación sobre el ántrax formaba parte de la iniciativa Patriot Grid de United Devices para combatir el terrorismo biológico. Se utilizó el software LigandFit (que ya se había utilizado en la fase 2 del proyecto de investigación sobre el cáncer), pero con un conjunto especializado de moléculas diana que atacaban las etapas avanzadas de la infección bacteriana por ántrax .
El proyecto se desarrolló entre el 22 de enero de 2002 y el 14 de febrero de 2002 y finalizó después de que se hubieran analizado un total de 3.570 millones de moléculas. Los resultados del proyecto de investigación se transmitieron a los científicos biológicos para que finalizaran el análisis de las simulaciones computacionales. [13]
Los socios del proyecto incluyeron la Universidad de Oxford .
El proyecto de investigación genética HMMER utilizó el modelo oculto de Markov para buscar patrones en secuencias de ADN genético. [14]
El proyecto de pruebas de rendimiento web se llevó a cabo como una oportunidad comercial con proveedores de alojamiento web seleccionados para ayudarlos a probar la escalabilidad de sus infraestructuras de servidor en períodos de alta demanda. [15]
En noviembre de 2007, Univa reposicionó grid.org como una comunidad para permitir que los usuarios interactuaran y discutieran temas relacionados con clusters y grids de código abierto. [16] Permitió a los usuarios descargar, obtener soporte, contribuir y reportar problemas sobre los productos basados en Globus Toolkit de código abierto ofrecidos por Univa. Se reportaron más de 100.000 visitantes únicos en 2008. [17] A mediados de 2010, se redirigió a Unicluster.org (un producto de Univa) y en 2012, se redirigió al sitio principal de Univa.