En biología química e ingeniería biomolecular , diseño racional ( RD ) es un término general que invita a la estrategia de crear nuevas moléculas con una determinada funcionalidad, basada en la capacidad de predecir cómo la estructura de la molécula (específicamente derivada de motivos ) afectará su comportamiento a través de modelos físicos. Esto se puede hacer desde cero o haciendo variaciones calculadas sobre una estructura conocida, y normalmente complementa la evolución dirigida .
Como ejemplo, el diseño racional se utiliza para descifrar la estabilidad del colágeno , mapear las interacciones ligando-receptor, revelar el plegamiento y la dinámica de las proteínas y crear estructuras extrabiológicas mediante el uso de aminoácidos fluorados . [1] Para tratar el cáncer , se utiliza el diseño racional para terapias dirigidas en las que se diseñan proteínas para modificar la comunicación de las células con su entorno. [2] También existe el diseño racional de moléculas de alfa-alquil auxina , que son análogos de auxina capaces de unirse y bloquear la formación del complejo receptor hormonal . [3]
Otras aplicaciones del diseño racional incluyen: