El río Saja es un río de la comunidad autónoma de Cantabria , al norte de España . Desemboca en el mar Cantábrico. Parte de su curso se encuentra dentro del Parque Natural Saja-Besaya
El río Saja nace a 1.700 metros de altitud y discurre con rapidez por una pronunciada cuenca en forma de V durante los primeros kilómetros. Pasado el pueblo de Fresneda el valle comienza a abrirse y se desarrolla una amplia llanura aluvial en el valle de Cabuérniga.
En cuanto a la conservación ecológica del río, es buena desde su nacimiento hasta el puente de Santa Lucía, a partir de donde empieza a presentar alteraciones importantes, estando catalogado como medianamente conservado. Más abajo, en la confluencia con el Besaya, las alteraciones son ya graves o muy graves, estando catalogado como mal conservado. [1]
43°26′06″N 4°02′06″O / 43.435, -4.035