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Protocatecuato 3,4-dioxigenasa

En enzimología , una protocatecuato 3,4-dioxigenasa ( EC 1.13.11.3) es una enzima que cataliza la reacción química.

3,4-dihidroxibenzoato + O 2 3-carboxi-cis,cis-muconato

Así, los dos sustratos de esta enzima son el 3,4-dihidroxibenzoato ( ácido protocatequiico ) y el O2 , mientras que su producto es el 3-carboxi-cis,cis-muconato .

Esta enzima pertenece a la familia de las oxidorreductasas , concretamente a las que actúan sobre donantes únicos con O 2 como oxidante e incorporación de dos átomos de oxígeno al sustrato (oxigenasas). El nombre sistemático de esta clase de enzimas es protocatecuato: oxígeno 3,4-oxidorreductasa (desciclizante) . Otros nombres de uso común incluyen protocatecuato oxigenasa , ácido protocatecuico oxidasa , 3,4-dioxigenasa protocatecuico y 3,4-oxigenasa protocatecuico . Esta enzima participa en la degradación del benzoato mediante hidroxilación y degradación del 2,4-diclorobenzoato. Emplea un cofactor , el hierro .

Se ha descubierto que esta enzima es eficaz para mejorar la estabilidad de los fluoróforos orgánicos en experimentos de una sola molécula. [1] Preparaciones comerciales de la enzima aislada de Pseudomonas spp. generalmente requieren una purificación adicional para eliminar la actividad nucleasa contaminante fuerte.

Estudios estructurales

A finales de 2007, se han resuelto 37 estructuras para esta clase de enzimas, con los códigos de acceso de PDB 1EO2, 1EO9, 1EOA, 1EOB, 1EOC, 1YKK, 1YKL, 1YKM, 1YKN, 1YKO, 1YKP, 2BUM, 2BUQ, 2BUR, 2BUT, 2BUU, 2BUV, 2BUW, 2BUX, 2BUY, 2BUZ, 2BV0, 2PCD, 3PCA, 3PCB, 3PCC, 3PCD, 3PCE, 3PCF, 3PCG, 3PCH, 3PCI, 3PCJ, 3PCK, 3PCL, 3PCM y 3PCN.

Ver también

Referencias

  1. ^ Aitken CE, Marshall RA, Puglisi JD (2008). "Un sistema de eliminación de oxígeno para mejorar la estabilidad del tinte en experimentos de fluorescencia de una sola molécula". Biofísica. J.94 (5): 1826–1835. Código Bib : 2008BpJ....94.1826A. doi :10.1529/biophysj.107.117689. PMC  2242739 . PMID  17921203.