Esta lista de software de predicción de estructura de proteínas resume las herramientas de software más notables utilizadas en la predicción de estructura de proteínas , incluidos el modelado de homología , el enhebrado de proteínas , los métodos ab initio , la predicción de estructura secundaria y la predicción de hélice transmembrana y péptido señal.
A continuación se muestra una lista que separa los programas según el método utilizado para la predicción de la estructura.
La lista detallada de programas se puede encontrar en Lista de programas de predicción de la estructura secundaria de proteínas