Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens
La proteína 3 de unión al ARN putativa es una proteína que en los humanos está codificada por el gen RBM3 . [4] [5]
Función
Este gen es miembro de la familia de proteínas de unión a ARN ricas en glicina y codifica una proteína con un dominio de motivo de reconocimiento de ARN (RRM). La expresión de este gen es inducida por el choque frío y la baja tensión de oxígeno. Existe un pseudogén en el cromosoma 1. Se han caracterizado variantes de empalme transcripcional alternativas, que codifican diferentes isoformas . [5]
RBM3 es una proteína de unión al ARN inducida por frío y está involucrada en la biogénesis del ARNm y ejerce efectos antiapoptóticos. [ 6] Según el perfil basado en anticuerpos y el análisis transcriptómico , la proteína RBM3 está presente en todos los tejidos humanos analizados [7] y, según la microscopía confocal, se localiza principalmente en el nucleoplasma . [8]
Importancia clínica
RBM3 es un protooncogén asociado con la progresión tumoral y la metástasis y es un biomarcador potencial del cáncer . [6] Según los datos de supervivencia de los pacientes, los altos niveles de proteína RBM3 en las células tumorales son un biomarcador pronóstico favorable en el cáncer colorrectal . [9]
Referencias
- ^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000102317 – Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
- ^ Derry JM, Kerns JA, Francke U (diciembre de 1995). "RBM3, un nuevo gen humano en Xp11.23 con un supuesto dominio de unión al ARN". Human Molecular Genetics . 4 (12): 2307–11. doi :10.1093/hmg/4.12.2307. PMID 8634703.
- ^ ab "Gen Entrez: motivo de unión al ARN RBM3 (RNP1, RRM) proteína 3".
- ^ ab Zhou RB, Lu XL, Zhang CY, Yin DC (marzo de 2017). "Proteína 3 con motivo de unión al ARN: un posible biomarcador en el cáncer y un objetivo terapéutico en la neuroprotección". Oncotarget . 8 (13): 22235–22250. doi :10.18632/oncotarget.14755. PMC 5400660 . PMID 28118608.
- ^ "Expresión tisular de RBM3 - Resumen". Atlas de proteínas humanas .
- ^ "Atlas celular - RBM3". Atlas de proteínas humanas .
- ^ "Expresión de RBM3 en el cáncer - Resumen". Atlas de proteínas humanas .
Lectura adicional
- Danno S, Nishiyama H, Higashitsuji H, Yokoi H, Xue JH, Itoh K, Matsuda T, Fujita J (julio de 1997). "Nivel de transcripción aumentado de RBM3, un miembro de la familia de proteínas de unión a ARN ricas en glicina, en células humanas en respuesta al estrés por frío". Biochemical and Biophysical Research Communications . 236 (3): 804–7. doi :10.1006/bbrc.1997.7059. PMID 9245737.
- Chappell SA, Mauro VP (septiembre de 2003). "El sitio de entrada al ribosoma interno (IRES) contenido en el ARNm de la proteína 3 con motivo de unión al ARN (Rbm3) está compuesto de elementos funcionalmente distintos". The Journal of Biological Chemistry . 278 (36): 33793–800. doi : 10.1074/jbc.M303495200 . PMID 12824175.
- Wellmann S, Bührer C, Moderegger E, Zelmer A, Kirschner R, Koehne P, Fujita J, Seeger K (abril de 2004). "Expresión regulada por oxígeno de las proteínas de unión al ARN RBM3 y CIRP mediante un mecanismo independiente de HIF-1". Journal of Cell Science . 117 (Pt 9): 1785–94. doi : 10.1242/jcs.01026 . PMID 15075239.
- Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB, Mukherji M, Stettler-Gill M, Peters EC (mayo de 2004). "Perfil fosfoproteómico robusto de sitios de fosforilación de tirosina de células T humanas mediante cromatografía de afinidad por metales inmovilizados y espectrometría de masas en tándem". Química analítica . 76 (10): 2763–72. doi :10.1021/ac035352d. PMID 15144186.
- Dellis S, Strickland KC, McCrary WJ, Patel A, Stocum E, Wright CF (noviembre de 2004). "Interacciones proteicas entre los factores de transcripción tardía del virus vaccinia". Virology . 329 (2): 328–36. doi :10.1016/j.virol.2004.08.017. hdl : 10161/15063 . PMID 15518812.
- Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (enero de 2005). "Dinámica del proteoma nucleolar". Nature . 433 (7021): 77–83. Bibcode :2005Natur.433...77A. doi :10.1038/nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
- Ong SE, Mittler G, Mann M (noviembre de 2004). "Identificación y cuantificación de sitios de metilación in vivo mediante SILAC de metilación pesada". Nature Methods . 1 (2): 119–26. doi :10.1038/nmeth715. PMID 15782174. S2CID 6654604.
- Martínez-Arribas F, Agudo D, Pollán M, Gómez-Esquer F, Díaz-Gil G, Lucas R, Schneider J (abril de 2006). "Correlación positiva entre la expresión de genes RBM del cromosoma X (RBMX, RBM3, RBM10) y el gen proapoptótico Bax en cáncer de mama humano". Journal of Cellular Biochemistry . 97 (6): 1275–82. doi :10.1002/jcb.20725. PMID 16552754. S2CID 9804734.