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PABPC1

La proteína 1 de unión a poliadenilato es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen PABPC1 . [5] La proteína PABP1 se une al ARNm y facilita una variedad de funciones, como el transporte hacia dentro y hacia fuera del núcleo, la degradación, la traducción y la estabilidad. Hay dos proteínas PABP1 independientes, una que se encuentra en el núcleo (PABPN1) y la otra que se encuentra en el citoplasma (PABPC1). La ubicación de PABP1 afecta el papel de esa proteína y su función con el ARN. [6]

Función

La proteína de unión a poli(A) (PAB o PABP), que se encuentra unida a la cola poli(A) 3' del ARNm eucariota, es necesaria para el alargamiento de la poli(A) y la terminación de la traducción. En los seres humanos, las PABP comprenden una pequeña isoforma nuclear y una familia de genes conservados de otras proteínas de unión a poli(A) . [suministrada por OMIM] [7]

PABPC1 suele difundirse dentro del citoplasma y concentrarse en sitios de alta concentración de ARNm, como gránulos de estrés, cuerpos de procesamiento y lugares de alta actividad traduccional. PABPC1 también está asociado con la degradación del ARNm mediada por sinsentidos (NMD). PABPC1 se une a la cola de poli(A) e interactúa con eIF4G, que estabiliza la circularización de los ARNm. Esta estructura es necesaria para la prevención de la degradación del ARNm a través de NMD. [8]

En el núcleo, la PABP1 se une a las colas de poli(A) de los pre-ARNm para facilitar la estabilidad, la exportación, el transporte y la degradación. La unión de la PABP1 también es necesaria para la degradación mediada por el núcleo. La PABPC1 contiene cuatro motivos de reconocimiento de ARN (RRM). Los dos primeros, RRM1 y RRM2, se unen tanto a la α-importina como a la cola de poli(A) del ARNm procesado. Esta característica evita que el ARNm regrese al núcleo. [6]

Interacciones

Se ha demostrado que PABPC1 interactúa con:

Referencias

  1. ^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000070756 – Ensembl , mayo de 2017
  2. ^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000022283 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ^ "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
  5. ^ Grange T, de Sa CM, Oddos J, Pictet R (junio de 1987). "Proteína de unión a poliadenilato de ARNm humano: conservación evolutiva de un motivo de unión a ácidos nucleicos". Nucleic Acids Research . 15 (12): 4771–87. doi :10.1093/nar/15.12.4771. PMC 305917 . PMID  2885805. 
  6. ^ ab Gray NK, Hrabálková L, Scanlon JP, Smith RW (diciembre de 2015). "Proteínas de unión a poli(A) y localización del ARNm: ¿quién manda?". Biochemical Society Transactions . 43 (6): 1277–84. doi : 10.1042/BST20150171 . PMID  26614673.
  7. ^ "Gen Entrez: proteína de unión a poli(A) PABPC1, citoplasmática 1".
  8. ^ Fatscher T, Boehm V, Weiche B, Gehring NH (octubre de 2014). "La interacción de la proteína de unión a poli(A) citoplasmática con el factor de iniciación eucariota 4G suprime la degradación del ARNm mediada por sinsentidos". ARN . 20 (10): 1579–92. doi :10.1261/rna.044933.114. PMC 4174440 . PMID  25147240. 
  9. ^ Koloteva-Levine N, Pinchasi D, Pereman I, Zur A, Brandeis M, Elroy-Stein O (mayo de 2004). "La subunidad Apc5 del complejo promotor de anafase/ciclosoma interactúa con la proteína de unión a poli(A) y reprime la traducción mediada por el sitio de entrada interno del ribosoma". Biología molecular y celular . 24 (9): 3577–87. doi :10.1128/mcb.24.9.3577-3587.2004. PMC 387753 . PMID  15082755. 
  10. ^ Funakoshi Y, Doi Y, Hosoda N, Uchida N, Osawa M, Shimada I, Tsujimoto M, Suzuki T, Katada T, Hoshino S (diciembre de 2007). "Mecanismo de deadenilación del ARNm: evidencia de una interacción molecular entre el factor de terminación de la traducción eRF3 y las deadenilasas del ARNm". Genes & Development . 21 (23): 3135–48. doi :10.1101/gad.1597707. PMC 2081979 . PMID  18056425. 
  11. ^ ab Imataka H, ​​Gradi A, Sonenberg N (diciembre de 1998). "Una secuencia de aminoácidos N-terminal recientemente identificada de eIF4G humano se une a la proteína de unión a poli(A) y funciona en la traducción dependiente de poli(A)". The EMBO Journal . 17 (24): 7480–9. doi :10.1093/emboj/17.24.7480. PMC 1171091 . PMID  9857202. 
  12. ^ Hoshino S, Imai M, Kobayashi T, Uchida N, Katada T (junio de 1999). "El factor liberador de la cadena polipeptídica eucariota (eRF3/GSPT) que lleva la señal de terminación de la traducción a la cola 3'-Poli(A) del ARNm. Asociación directa de erf3/GSPT con la proteína de unión al poliadenilato". The Journal of Biological Chemistry . 274 (24): 16677–80. doi : 10.1074/jbc.274.24.16677 . PMID  10358005.
  13. ^ Roy G, De Crescenzo G, Khaleghpour K, Kahvejian A, O'Connor-McCourt M, Sonenberg N (junio de 2002). "Paip1 interactúa con la proteína de unión a poli(A) a través de dos motivos de unión independientes". Biología molecular y celular . 22 (11): 3769–82. doi :10.1128/mcb.22.11.3769-3782.2002. PMC 133836 . PMID  11997512. 
  14. ^ Craig AW, Haghighat A, Yu AT, Sonenberg N (abril de 1998). "La interacción de la proteína de unión al poliadenilato con el homólogo de eIF4G PAIP mejora la traducción". Nature . 392 (6675): 520–3. Bibcode :1998Natur.392..520C. doi :10.1038/33198. PMID  9548260. S2CID  10891925.
  15. ^ Khaleghpour K, Kahvejian A, De Crescenzo G, Roy G, Svitkin YV, Imataka H, ​​O'Connor-McCourt M, Sonenberg N (agosto de 2001). "Interacciones duales del represor traduccional Paip2 con la proteína de unión a poli(A)". Biología molecular y celular . 21 (15): 5200–13. doi :10.1128/MCB.21.15.5200-5213.2001. PMC 87244 . PMID  11438674. 

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