La temporada 1988-89 de la Liga Helénica de Fútbol fue la número 36 en la historia de la Liga Helénica de Fútbol , una competición de fútbol en Inglaterra.
La Premier Division contó con 15 clubes que compitieron en la división la temporada pasada, junto con dos nuevos clubes, promovidos desde la División Uno:
La División Uno contó con 13 clubes que compitieron en la división la temporada pasada, junto con dos clubes nuevos: