El polimorfismo de conformación de cadena sencilla ( SSCP ), o polimorfismo de cadena simple , se define como una diferencia conformacional de secuencias de nucleótidos monocatenarios de longitud idéntica inducida por diferencias en las secuencias bajo ciertas condiciones experimentales. Esta propiedad permite distinguir las secuencias mediante electroforesis en gel , que separa los fragmentos según sus diferentes conformaciones. [1]
Un cambio de un solo nucleótido en una secuencia particular, como se observa en un ADN de doble cadena, no se puede distinguir mediante técnicas de electroforesis en gel, lo que se puede atribuir al hecho de que las propiedades físicas de las cadenas dobles son casi idénticas para ambos alelos. Después de la desnaturalización, el ADN de cadena sencilla experimenta un plegamiento tridimensional característico y puede asumir un estado conformacional único basado en su secuencia de ADN. La diferencia de forma entre dos cadenas de ADN de cadena sencilla con diferentes secuencias puede hacer que migren de manera diferente a través de un gel de electroforesis, aunque el número de nucleótidos sea el mismo, lo que es, de hecho, una aplicación de SSCP.
La SSCP solía ser una forma de descubrir nuevos polimorfismos de ADN aparte de la secuenciación de ADN, pero ahora está siendo suplantada por técnicas de secuenciación debido a su eficiencia y precisión. [2] En la actualidad, la SSCP es más aplicable como herramienta de diagnóstico en biología molecular. Se puede utilizar en la genotipificación para detectar individuos homocigotos de diferentes estados alélicos, así como individuos heterocigotos que deberían mostrar patrones distintos en un experimento de electroforesis. [3] La SSCP también se utiliza ampliamente en virología para detectar variaciones en diferentes cepas de un virus, con la idea de que una partícula de virus particular presente en ambas cepas habrá sufrido cambios debido a la mutación, y que estos cambios harán que las dos partículas asuman conformaciones diferentes y, por lo tanto, sean diferenciables en un gel SSCP. [4]
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