El pliegue de la muerte es un motivo de estructura terciaria que se encuentra comúnmente en proteínas involucradas en la apoptosis o procesos relacionados con la inflamación . Este motivo se encuentra comúnmente en dominios que participan en interacciones proteína-proteína que conducen a la formación de grandes complejos funcionales. Ejemplos de dominios de muerte incluyen el dominio de muerte (DD), el dominio efector de muerte (DED), el dominio de reclutamiento de caspasa (CARD) y el dominio de pirina (PYD).
Los dominios del pliegue de la muerte son una superfamilia de dominios conservada evolutivamente que median la señalización apoptótica. Los dos tipos de apoptosis , extrínseca e intrínseca, están estrechamente regulados por la interacción de vías activadoras e inhibidoras. Las interacciones entre los cuatro motivos diferentes de la muerte son un mecanismo unificador en ambos tipos de apoptosis.
Hay una gran diferencia en la secuencia de aminoácidos primaria de los cuatro motivos diferentes del pliegue de la muerte, pero cada uno tiene una estructura tridimensional similar. Los motivos del pliegue de la muerte se caracterizan por seis a siete hélices alfa fuertemente enrolladas dispuestas en un pliegue en "clave griega". Los motivos permiten interacciones específicas con proteínas que contienen el dominio homotípico correcto. [1]
Las proteínas que contienen CARD se encuentran en todo el reino animal. Los dominios CARD están presentes en varias procaspasas de mamíferos y tienen funciones en la apoptosis , el procesamiento de citoquinas , la defensa inmune y la activación de NF-κB . En insectos y nematodos , las CARD hasta ahora parecen restringidas a proteínas apoptóticas.
Los DD se encuentran principalmente en vertebrados (aunque también están presentes en algunos otros animales). Los DD están contenidos en receptores de citoquinas de la familia de receptores de TNF . Las proteínas DD funcionan en la apoptosis y la señalización de NF-κB en mamíferos, pero solo en la señalización de NF-κB en Drosophila .
Las DED están presentes en las caspasas y participan en la activación de las caspasas. Las caspasas que contienen DED funcionan en la apoptosis inducida por el receptor de muerte en mamíferos, pero difieren en los insectos donde participan en la señalización de NF-κB y las respuestas antibacterianas.
Las PIRINAS son el dominio mortal descubierto más recientemente y sus funciones e interacciones aún no se han dilucidado claramente.
Se cree que los motivos de la muerte ejercen sus efectos únicamente a través de interacciones monovalentes y homotípicas. En estas interacciones, los pliegues de la muerte se unen a otro dominio que contiene el pliegue de la muerte a través del mismo tipo de dominio de interacción de proteínas. Estas interacciones son muy específicas y no se conocen interacciones entre diferentes tipos de dominios de muerte; en todos los casos conocidos, los socios de unión tienen un dominio homólogo (DD-DD, CARD-CARD, DED-DED). Se cree que la función de estas interacciones homotípicas es la de autoensamblaje. [1] Esto da como resultado grandes estructuras de múltiples subunidades hechas de un solo tipo de proteína.