En biología molecular , SNORD115 (también conocido como HBII-52 ) es una molécula de ARN no codificante (ARNnc) conocida como ARN nucleolar pequeño que generalmente funciona guiando la modificación de otros ARN no codificantes . Este tipo de ARN modificador suele localizarse en el nucléolo de la célula eucariota, que es un sitio importante de biogénesis de ARNsn. HBII-52 se refiere al gen humano, mientras que RBII-52 se usa para el gen de rata y MBII-52 se usa para nombrar el gen de ratón.
HBII-52 pertenece a la clase de caja C/D de snoRNA que contienen los motivos de secuencia conservados conocidos como caja C (UGAUGA) y caja D (CUGA). La mayoría de los miembros de la familia Box C/D funcionan dirigiendo la 2'-O- metilación específica del sitio de los ARN sustrato. [1]
En el genoma humano, HBII-52 está codificado en una matriz repetida en tándem con otro snoRNA de caja C/D, HBII-85 (SNORD116) , en la región del síndrome de Prader-Willi (PWS) del cromosoma 15 . [2] Sin embargo, una microdeleción en una familia del grupo snoRNA HBII-52 lo ha excluido de desempeñar un papel importante en la enfermedad. [3] HBII-52 se encuentra en 47 copias en tándem casi idénticas en el cromosoma humano 15q11-13. Este locus tiene impronta materna, lo que significa que sólo se transcribe la copia paterna del locus. HBII-52 se expresa exclusivamente en el cerebro pero está ausente en los pacientes con SPW. HBII-52 carece de complementariedad significativa con los ARN ribosómicos , pero tiene una región de 18 nucleótidos de complementariedad conservada con el ARNm del receptor de serotonina 2C . [4] El receptor de serotonina 2C también se expresa en el cerebro. Se ha demostrado que es probable que este snoRNA se una a un elemento silenciador del exón Vb, aumentando su inclusión y producción de una forma de empalme funcional del receptor de serotonina 2C.
El locus cromosómico que contiene el grupo de genes SNORD115 se ha duplicado en muchos individuos con rasgos autistas . [5] [6] Un modelo de ratón diseñado para tener una duplicación del grupo SNORD115 muestra un comportamiento similar al autista. [7]
Existe evidencia de que una forma truncada de MBII-52 (SNORD115 encontrada en ratón) regula el corte y empalme alternativo de los genes codificadores de proteínas DPM2 , TAF1 , RALGPS1 , PBRM1 y CRHR1 . [8]
Referencias
- ^ Galardi, S.; Fática, A.; Bachí, A.; Scaloni, A.; Presutti, C.; Bozzoni, I. (octubre de 2002). "Los snoRNP de caja C / D purificados pueden reproducir in vitro la 2'-O-metilación específica del sitio del ARN objetivo". Biología Molecular y Celular . 22 (19): 6663–6668. doi :10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC 134041 . PMID 12215523.
- ^ Cavaillé J, Buiting K, Kiefmann M, et al. (2000). "Identificación de genes de ARN nucleolar pequeños impresos y específicos del cerebro que exhiben una organización genómica inusual". Proc. Nacional. Acad. Ciencia. EE.UU . 97 (26): 14311–6. Código bibliográfico : 2000PNAS...9714311C. doi : 10.1073/pnas.250426397 . PMC 18915 . PMID 11106375.
- ^ Runte M, Varon R, Horn D, Horsthemke B, Buiting K (2005). "Exclusión del grupo de genes HBII-52 de snoRNA de la caja C / D de un papel importante en el síndrome de Prader-Willi". Hum Genet . 116 (3): 228–30. doi :10.1007/s00439-004-1219-2. PMID 15565282. S2CID 23190709.
- ^ Kishore S, Stamm S (enero de 2006). "El snoRNA HBII-52 regula el empalme alternativo del receptor de serotonina 2C". Ciencia . 311 (5758): 230–2. Código Bib : 2006 Ciencia... 311.. 230K. doi : 10.1126/ciencia.1118265 . PMID 16357227. S2CID 44527461.
- ^ Bolton PF, Veltman MW, Weisblatt E, et al. (Septiembre de 2004). "Anomalías del cromosoma 15q11-13 y otras afecciones médicas en personas con trastornos del espectro autista". Psiquiatra. Genet . 14 (3): 131–7. doi :10.1097/00041444-200409000-00002. PMID 15318025. S2CID 37344935.
- ^ Cook EH, Scherer SW (octubre de 2008). "Variaciones en el número de copias asociadas con afecciones neuropsiquiátricas". Naturaleza . 455 (7215): 919–23. Código Bib :2008Natur.455..919C. doi : 10.1038/naturaleza07458. PMID 18923514. S2CID 4377899.
- ^ Nakatani J, Tamada K, Hatanaka F y col. (junio de 2009). "Comportamiento anormal en un modelo de ratón diseñado con cromosomas para la duplicación de 15q11-13 humano observado en el autismo". Celúla . 137 (7): 1235–46. doi :10.1016/j.cell.2009.04.024. PMC 3710970 . PMID 19563756.
- ^ Kishore S, Khanna A, Zhang Z, Hui J, Balwierz PJ, Stefan M, Beach C, Nicholls RD, Zavolan M, Stamm S (2010). "El snoRNA MBII-52 (SNORD 115) se procesa en ARN más pequeños y regula el empalme alternativo". Hum Mol Genet . 19 (7): 1153–64. doi :10.1093/hmg/ddp585. PMC 2838533 . PMID 20053671.
enlaces externos
- Página de ARN nucleolar pequeño SNORD115 en Rfam
- Entrada para SNORD115 en snoRNABase