Proteína arginina deiminasa

En enzimología , una proteína-arginina deiminasa ( EC 3.5.3.15) es una enzima que cataliza una forma de modificación postraduccional llamada desiminación de arginina o citrulinación :

proteína L -arginina + _H2O proteína L - citrulina + _NH3 ${\displaystyle \rightleftharpoons }$

Así, los dos sustratos de esta enzima son la proteína L -arginina (residuo de arginina dentro de una proteína) y H ₂ O , mientras que sus dos productos son la proteína L -citrulina y NH 3 :

Esta enzima pertenece a la familia de las hidrolasas , aquellas que actúan sobre enlaces carbono-nitrógeno distintos de los enlaces peptídicos , concretamente en amidinas lineales . El nombre sistemático de esta clase de enzimas es proteína-L-arginina iminohidrolasa . Esta enzima también se denomina peptidilarginina deiminasa .

Estudios estructurales

A finales de 2007, se han resuelto siete estructuras para esta clase de enzimas, con códigos de acceso PDB 1WD8, 1WD9, 1WDA, 2DEW, 2DEX, 2DEY y 2DW5.

Proteínas de mamíferos

Los mamíferos tienen 5 proteínas-arginina deiminasas, con símbolos

• PADI1 , PADI2 , PADI3 , PADI4 , ^[1] PADI6 ^[2]

A excepción de los roedores , allí el uso de mayúsculas y minúsculas es diferente:

• Padi1, Padi2, Padi3, Padi4, Padi6 ^[3]

El caso diferente es sólo un artefacto histórico. No indica que las proteínas de los roedores sean especiales.

Referencias

1. Sams, KL; Mukai, C; Marks, BA; Mittal, C; Demeter, EA; Nelissen, S; Grenier, JK; Tate, AE; Ahmed, F; Coonrod, SA (octubre de 2022). "Pubertad retrasada, anomalías de gonadotropina y subfertilidad en ratones machos con doble knock-out de Padi2/Padi4". Reprod Biol Endocrinol . 20 (1): 150. doi : 10.1186/s12958-022-01018-w . PMC  9555066 . PMID  36224627.
2. "Resultados de la búsqueda de "peptidil arginina deiminasa"". Comité de Nomenclatura de Genes de Vertebrados . Consultado el 9 de febrero de 2022 .
3. "Detalle de la superfamilia de proteínas: proteína-arginina_deiminasa". Informática del genoma del ratón.

• Fujisaki M, Sugawara K (enero de 1981). "Propiedades de la peptidilarginina deiminasa de la epidermis de ratas recién nacidas". J. Biochem . 89 (1). Tokio: 257–63. doi :10.1093/oxfordjournals.jbchem.a133189. PMID  7217033.
• proteína-arginina+deiminasa en los encabezados de materias médicas (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU.