El Grupo A de la Copa América de 1999 fue uno de los tres grupos de naciones que compitieron en la Copa América de 1999. Estaba integrado por Paraguay , Bolivia , Perú y Japón . La fase de grupos comenzó el 29 de junio y finalizó el 5 de julio.
Paraguay ganó el grupo y enfrentó a Uruguay , el segundo mejor tercer clasificado, en los cuartos de final. Perú terminó segundo y enfrentó a México , el segundo del Grupo B , en los cuartos de final. Bolivia y Japón terminaron tercero y cuarto en el grupo, respectivamente, y fueron eliminados del torneo.
Equipos que avanzaron a cuartos de final
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