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Obelisco (biología)

Un obelisco es un " elemento similar a un viroide " de un tipo descrito por primera vez en una preimpresión de enero de 2024 , cuyos autores dicen que "los obeliscos forman su propio grupo filogenético distinto ", [1] [2] [3] ya que sus secuencias de ARN , descubiertas por metatranscriptómica asistida por computadora , no son homólogas con la secuencia genómica de ninguna otra forma de vida. [1] Actualmente, solo hay unos pocos métodos disponibles para la identificación de estos elementos a partir de datos de NGS . [4]

Como se desconoce su relación con otros organismos, son un ejemplo de los incertae sedis o "taxones enigmáticos".

Distribución y patología

Tinción de Gram de Streptococcus sanguinis con un aumento de x 4000.

Se han encontrado obeliscos en muestras de heces humanas y en el interior de especímenes de Streptococcus sanguinis , una especie de bacteria, extraídos de bocas humanas. Algunos sujetos humanos albergaron obeliscos durante más de 300 días. El estudio inicial mostró la presencia de obeliscos en aproximadamente el 7 por ciento de las muestras de heces y aproximadamente el 50 por ciento de las muestras de saliva de individuos que vivían en todos los continentes. [1]

Todavía queda por determinar el efecto de los obeliscos sobre la salud humana, si lo hay, [2] al igual que cuestiones como sus ciclos de vida y de qué factores depende su replicación. [1]

Genética y bioquímica

Las características de los obeliscos incluyen conjuntos de genomas de ARN circulares con alrededor de 1000 pares de bases y estructuras secundarias en forma de varilla que abarcan todo el genoma. A diferencia de los viroides, su ARN se traduce en proteínas, llamadas provisionalmente " oblins " en la preimpresión. Las dos proteínas enumeradas allí se han denominado Oblin-1 y Oblin-2. [1]

Las primeras predicciones estructurales indican que Oblin-1 puede unirse a iones metálicos y, por lo tanto, podría estar involucrado en la señalización celular . Oblin-2 presenta un sitio de unión que es típico de los complejos proteicos y, por lo tanto, podría unirse a las enzimas de su célula huésped. [2]

Nombre

La preimpresión dice: "Debido a una fuerte estructura secundaria similar a una varilla predicha, llamamos a este grupo de ARN Obelisco-alfa"... "Con 1164 nt de longitud, la estructura secundaria similar a una varilla fue sorprendente..." [1] (Secundaria con respecto a la estructura de ensamblaje circular).

Referencias

  1. ^ abcdef Ivan N. Zheludev; Robert C. Edgar; Maria Jose Lopez-Galiano; Marcos de la Peña; Artem Babaian; Ami S. Bhatt; Andrew Z. Fire (21 de enero de 2024). "Colonizadores de microbiomas humanos similares a viroides". bioRxiv . doi :10.1101/2024.01.20.576352. PMC  10827157 . PMID  38293115. Wikidata  Q124389714.
  2. ^ abc Sidik, Saima (29 de enero de 2024). «Se descubren fragmentos de ARN 'extrañamente extraños' que infestan los microbios de nuestros intestinos». Nature . doi :10.1038/d41586-024-00266-7. PMID  38291328. S2CID  267332809. Archivado desde el original el 30 de enero de 2024 . Consultado el 31 de enero de 2024 .
  3. ^ Pennisi, Elizabeth (26 de enero de 2024). «'Es una locura': se encuentran nuevas entidades similares a virus en los microbios intestinales humanos». Science . doi :10.1126/science.znxt3dk. Archivado desde el original el 30 de enero de 2024 . Consultado el 31 de enero de 2024 .
  4. ^ Kremer, Frederico; de Barros, Daniele (2024). "Tormentor: Un obelisco de predicción y anotación". BioRxiv.org . BioRxiv. doi :10.1101/2024.05.30.596730 . Consultado el 3 de junio de 2024 .