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Red metabólica

Una red metabólica es el conjunto completo de procesos metabólicos y físicos que determinan las propiedades fisiológicas y bioquímicas de una célula . Como tal, estas redes comprenden las reacciones químicas del metabolismo , las vías metabólicas , así como las interacciones reguladoras que guían estas reacciones.

Con la secuenciación de genomas completos , ahora es posible reconstruir la red de reacciones bioquímicas en muchos organismos, desde las bacterias hasta los humanos. Varias de estas redes están disponibles en línea: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes ( KEGG ), [1] EcoCyc , [2] BioCyc [3] y metaTIGER. [4] Las redes metabólicas son herramientas poderosas para estudiar y modelar el metabolismo.


Usos

Las redes metabólicas se pueden utilizar para detectar patrones de comorbilidad en pacientes enfermos. [5] Ciertas enfermedades, como la obesidad y la diabetes , pueden estar presentes en el mismo individuo al mismo tiempo, a veces una enfermedad es un factor de riesgo significativo para la otra enfermedad. [6] Los fenotipos de la enfermedad en sí mismos normalmente son la consecuencia de la incapacidad de la célula para descomponer o producir un sustrato esencial. Sin embargo, un defecto enzimático en una reacción puede afectar los flujos de otras reacciones posteriores. Estos efectos en cascada acoplan las enfermedades metabólicas asociadas con reacciones posteriores que resultan en efectos de comorbilidad. Por lo tanto, las redes de enfermedades metabólicas se pueden utilizar para determinar si dos trastornos están conectados debido a sus reacciones correlacionadas. [5]

Véase también

Referencias

  1. ^ "GenomeNet". www.genome.ad.jp . Archivado desde el original el 24 de febrero de 2009. Consultado el 1 de abril de 2020 .
  2. ^ "EcoCyc: Enciclopedia de genes y vías metabólicas de E. coli". www.ecocyc.org .
  3. ^ "Colección de bases de datos de genomas y vías de BioCyc". biocyc.org .
  4. ^ "metaTIGER - Home". www.bioinformatics.leeds.ac.uk . Archivado desde el original el 2012-03-04 . Consultado el 2010-06-09 .
  5. ^ ab Lee, D.- S.; Park, J.; Kay, KA; Christakis, NA; Oltvai, ZN; Barabasi, A.- L. (2008). "Las implicaciones de la topología de la red metabólica humana para la comorbilidad de la enfermedad". Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 105 (29): 9880–9885. doi : 10.1073/pnas.0802208105 . PMC 2481357 . PMID  18599447. 
  6. ^ Ross, R.; Dagnone, D.; Jones, P. J.; Smith, H.; Paddags, A.; Hudson, R.; Janssen, I. (2000). "Reducción de la obesidad y las afecciones comórbidas relacionadas después de la pérdida de peso inducida por la dieta o la pérdida de peso inducida por el ejercicio en hombres. Un ensayo controlado aleatorizado". Anales de Medicina Interna . 133 (2): 92–103. doi :10.7326/0003-4819-133-2-200007180-00008. PMID  10896648. S2CID  13415272.