Los miembros de Nanoarchaeota están asociados con diferentes organismos hospedadores y condiciones ambientales. [3] A pesar de su pequeño tamaño, un genoma reducido y una respiración limitada, los miembros de Nanoarchaeota tienen características metabólicas inusuales. Por ejemplo, N. equitans tiene un sistema de comunicación intercelular complejo y altamente desarrollado. [4]
La filogenia de Nanoarchaeota está anclada en su único representante cultivado, Nanoarchaeum equitans , que se agrupa en un grupo evolutivo separado de otras arqueas, [5] [6] que han sido reclasificadas recientemente. Análisis posteriores han demostrado que N. equitans divergió temprano en la evolución de Archaea, como lo indica la secuencia de ARNr 16S . Esto sugiere que ocupan una posición de ramificación profunda dentro de este grupo. [7]
Familia "Nanopusillaceae" Huber et al. 2011 [14] [Nanobdellaceae Kato et al. 2022 [15] ]
Género Nanobdella Kato et al. 2022 [15]
N. aerobiophila Kato y col. 2022 [15]
Género " Candidatus Nanoclepta" St. John et al. 2019 [16]
" Ca. N. minuta" St. John et al. 2019 [16]
Género " Candidatus Nanopusillus" Wurch et al. 2016 [17]
" Ca. N. acidilobi" Wurch et al. 2016 [17]
" Ca. N. stetteri" (Castelle et al. 2015) Rinke et al. 2020 [18]
Orden "Tiddalikarchaeales" Vázquez-Campos et al. 2021 [13]
Familia "Tiddalikarchaeaceae" Vázquez-Campos et al. 2021 [13]
Género " Candidatus Tiddalikarchaeum" Vázquez-Campos et al. 2021 [13]
" Ca. T. anstoanum" Vázquez-Campos et al. 2021 [13]
Orden "Parvarchaeales" Rinke et al. 2020 [18]
Familia "Parvarchaeaceae" Rinke et al. 2020 [18] ["Acidifodinimicrobiaceae" Luo et al. 2020 [19] ]
¿Género?" Candidatus Rehaiarchaeum fermentans" Rao et al. 2023
" Ca. R. fermentans" Rao et al. 2023
Género " Candidatus Acidifodinimicrobium" Luo et al. 2020 [19]
" Ca. A. mancum" Luo et al. 2020 [19]
Género " Candidatus Parvarchaeum" Baker et al. 2010 [20]
?" Ca. P. tengchongense" Rao et al. 2023
" Ca. P. acidiphilum" Baker et al. 2010 [20]
" Ca. P. paracidiphilum" corrig. Panadero y col. 2010 [20]
Características
Las células de N. equitans son esféricas con un diámetro de aproximadamente 400 nm , [2] y tienen una secuencia de ADN muy corta y compacta con todo el genoma conteniendo sólo 490.885 pares de bases . [6] Aunque tienen el código genético para llevar a cabo el procesamiento y la reparación, no pueden llevar a cabo ciertos procesos biosintéticos y metabólicos como la síntesis de lípidos, aminoácidos, cofactores o nucleótidos . [6] Debido a su maquinaria limitada, es un parásito obligado, el único conocido en las Archaea. [6] Debido a sus secuencias inusuales de ARNr ss, son difíciles de detectar utilizando métodos estándar de reacción en cadena de la polimerasa . [21] Las células de N. equitans contienen una capa S normal con simetría séxtuple con una constante reticular de 15 nm. [21]
Estructura del genoma
Las nanoarqueotas se caracterizan por células pequeñas de entre 100 y 400 nm de diámetro y genomas altamente aerodinámicos de 0,491-0,606 Mbp. [22] Los genomas de las nanoarqueotas descritas muestran diferentes grados de reducción, lo que es compatible con un estilo de vida dependiente del huésped. [23] Ciertas nanoarqueotas aún tienen genes para los sistemas CRISPR-Cas , los flagelos arqueológicos y la vía de la gluconeogénesis . [24]
Hábitat
Los nanoarqueotas son simbiontes obligados que crecen unidos a un huésped arqueológico conocido como Ignicoccus . [25] Tanto las fuentes termales terrestres como los respiraderos hidrotermales submarinos han producido aislados en el género Nanoarchaeum . [26] Sin embargo, existe evidencia de que los nanoarqueotas residen en una variedad de hábitats fuera de los respiraderos termales marinos. [3] Se ha descubierto que la evidencia genética de los miembros de Nanoarchaeota es omnipresente en las fuentes termales terrestres y los hábitats hipersalinos mesófilos utilizando cebadores creados con base en la secuencia del gen 16S rRNA de Nanoarchaeum equitans . [3] Además, el descubrimiento de secuencias ribosómicas en muestras de agua de la zona fótica tomadas lejos de los respiraderos hidrotermales plantea la posibilidad de que Nanoarchaeota sea un grupo ubicuo y diversificado de Archaea que puede vivir en hábitats con una variedad de temperaturas y entornos geoquímicos. [3]
Metabolismo
Aunque se desconoce gran parte del metabolismo de los miembros de Nanoarchaeota, su huésped es un autótrofo que crece con azufre elemental como aceptor de electrones y H 2 como donante de electrones . [26] La mayoría de los procesos metabólicos reconocidos, como la creación de monómeros como aminoácidos, nucleótidos y coenzimas , carecen de genes reconocibles en este organismo. [26]
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